Characteristics of the secondary clusters organization in some representatives of the Pseudomonas genus

Скорочена інформація про документ
dc.contributor.authorFan Wentong,
dc.date.accessioned2025-03-10T08:55:51Z
dc.date.available2025-03-10T08:55:51Z
dc.date.issued2024
dc.description.abstractВ роботі охарактеризовано та порівняно кластерну організацію генів вторинних метаболітів серед деяких представників роду Pseudomonas. За допомогою сервера antiSMASH в геномі Pseudomonas aeruginosa PA01 виявлено 16 кластерів біосинтетичних генів. Досліджувані види псевдомонад демонструють кластери генів, які переважно кодують нерибосомні пептид-синтетази та полікетид-синтази, які є ключовими для виробництва вторинних метаболітів. Ідентифіковано основні кластери генів, що відповідають за синтез наступних сполук: арилполієн, ациламінокислоти, β-лактами, β-лактони, бутиролактони, гомосеринелактони, лантипептид класу II, нерибосомальні пептиди, N-ацетилглутамін амід, феназини, сидерофори тощо. Встановлені вторинних метаболіти Pseudomonas spp. характеризуються широким спектром біологічної активності, що робить їх перспективними для розробки нових сполук з антимікробним потенціалом або для застосування в екологічній сфері.
dc.description.abstractDuring this study the characteristics and comparison of the cluster gene organization of secondary metabolites in some Pseudomonas genus representatives were carried out. A total of 16 biosynthetic gene clusters were found in the genome of Pseudomonas aeruginosa PA01 using the antiSMASH server. The studied Pseudomonas species exhibit gene clusters, predominantly encoding non-ribosomal peptide synthetases and polyketide synthases, which are crucial for secondary metabolite production. There are identified a major gene cluster classes that are responsible for the synthesis of such secondary metabolites as aryl polyene, acyl-amino acids, β-lactam, β-lactone, butyrolactone, tRNA-dependent cyclodipeptide synthases, ectoine, homoserinelactone, lantipeptide class II, nonribosomal peptides, N-acetylglutamine amide, phenazines, siderophores etc. The secondary metabolites of Pseudomonas spp. exhibit a diverse array of biological activities, rendering them promising for the development of novel antimicrobial agents and applications in environmental science.
dc.identifier.citationFan Wentong. Characteristics of the secondary clusters organization in some representatives of the Pseudomonas genus = Характеристика організації вторинних кластерів у деяких представників роду Pseudomonas : qualification work (thesis) for «Master» / Fan Wentong. – Odesa, 2024. – 55 P.
dc.identifier.urihttps://dspace.onu.edu.ua/handle/123456789/40760
dc.language.isoen
dc.publisherОдеський національний університет імені І. І. Мечникова
dc.subject162 Biotechnologies and bioengineering
dc.subjectмагістр
dc.subjectкластери біосинтетичних генів
dc.subjectPseudomonas spp.
dc.subjectвторинні метаболіти
dc.subjectспектр біологічної активності
dc.subjectфілогенетичний аналіз
dc.subjectbiosynthetic gene clusters
dc.subjectsecondary metabolites
dc.subjectbiological activity spectrum
dc.subjectphylogenetic analysis
dc.titleCharacteristics of the secondary clusters organization in some representatives of the Pseudomonas genus
dc.title.alternativeХарактеристика організації вторинних кластерів у деяких представників роду Pseudomonas
dc.typeDiplomas
Файли
Контейнер файлів
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
162_Fan_Wentong1.docx
Розмір:
29.35 KB
Формат:
Microsoft Word XML
Завантажити
Ліцензійна угода
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
license.txt
Розмір:
1.71 KB
Формат:
Item-specific license agreed upon to submission
Опис:
Завантажити
Зібрання
Магістри Біолог. ф-т