Аналіз поліморфізму γ-гліадинових генів в сортах м'якої пшениці за допомогою алель-специфічних ПЛР-маркерів
Ескіз недоступний
Дата
2018
Науковий керівник
Укладач
Редактор
Назва журналу
ISSN
E-ISSN
Назва тому
Видавець
Одеський національний університет імені І. І. Мечникова
Анотація
Проаналізовано поліморфізм алель-специфічних SNP маркерів за допомогою ПЛР, у генах гліадинів пшениці, локусів Gli-A1, Gli-B1 та Gli-D1. Вперше виявлено чітке співвідношення алельних варіантів електрофоретичних блоків гліадинів з поліморфізмом за довжиною продуктів ПЛР SNP алелів у Gli-B1 локусі, що є найбільш поліморфним за рахунок мікросателіту. Gli-A1 та Gli-D1 маркери характеризуються низькою частотою Gli-A1.2 та Gli-D1.2 алелів, а також часто в них зустрічаються два алеля одночасно. BLAST аналіз у базі даних NCBІ показав присутність у деяких нуклеотидних послідовностей одночасно двох копій SNP алелів Gli-A1 локусу.
Роботу викладено на 77 сторінках, вона містить 7 таблиць та 18 рисунків. Наведено посилання на 62 джерела літератури (8 кирилицею та 54 латиницею).
Polymorphism of allele-specific SNP markers of wheat gliadin genes in Gli-A1, Gli-B1 and Gli-D1 loci had been analyzed by using PCR. For the first time a clear correlation of the allelic variants of electrophoretic gliadin blocks with PCR products lengh of SNP alleles in Gli-B1 locus, which is most polymorphic due to microsatellite, was found. Gli-A1 and Gli-D1 markers are characterized by a low frequency of Gli-A1.2 and Gli-D1.2 alleles, and they often show the presence of two alleles together. The BLAST analysis in the NCBI database had showed the presence of two copies of the SNP alleles of Gli-A1 locus in at least two nucleotide sequences. The work described on 77 pages, it contains 7 tables and 18 figures. It contains 64 references (8 Cyrillic and 54 Latin).
Polymorphism of allele-specific SNP markers of wheat gliadin genes in Gli-A1, Gli-B1 and Gli-D1 loci had been analyzed by using PCR. For the first time a clear correlation of the allelic variants of electrophoretic gliadin blocks with PCR products lengh of SNP alleles in Gli-B1 locus, which is most polymorphic due to microsatellite, was found. Gli-A1 and Gli-D1 markers are characterized by a low frequency of Gli-A1.2 and Gli-D1.2 alleles, and they often show the presence of two alleles together. The BLAST analysis in the NCBI database had showed the presence of two copies of the SNP alleles of Gli-A1 locus in at least two nucleotide sequences. The work described on 77 pages, it contains 7 tables and 18 figures. It contains 64 references (8 Cyrillic and 54 Latin).
Опис
Ключові слова
091 біологія, Triticum aestivum L., гамма-гліадини, SNP поліморфізм, молекулярні маркери, ПЛР-аналіз, gamma-gliadin, SNP polymorphism, molecular markers, PCR-analysis
Бібліографічний опис
Попович, Ю.А. Аналіз поліморфізму γ-гліадинових генів в сортах м'якої пшениці за допомогою алель-специфічних ПЛР-маркерів = Analysis of the polymorphism of γ-gliadin genes in bread wheat varieties using allele-specific PCR markers : дипломна робота магістра / Ю. А. Попович; наук. кер. С. В. Чеботар; ОНУ ім. І. І. Мечникова, Біол. ф-т, Каф. генетики та молекулярної біології. – Одеса, 2018. – 67 с.