Характеристика кластерів генів нерибосомних пептид-синтетаз штамів актинобактерій, ізольованих з поверхонь мідій Чорного моря

Скорочена інформація про документ
dc.contributor.authorГрибов, Микита Володимирович
dc.date.accessioned2025-02-27T10:57:08Z
dc.date.available2025-02-27T10:57:08Z
dc.date.issued2024
dc.description.abstractПроведено дослідження актинобактерій роду Streptomyces ізольованих з поверхонь мідій Одеської затоки Чорного моря на виявлення генних кластерів нерибосомних пептид-синтетаз. За результатами досліджень у штамів Streptomyces ambofaciens Myt7b, Streptomyces ambofaciens ONU 561 були виявлені генні кластери. Відображено морфологічні та культуральні властивості штамів. Дослідження штамів актинобактерій з кластерами NRPS, на антагоністичну активність проти індикаторних мікроорганізмів Kocuria rhizophila DSM 348 та Рseudomonas putidа KT 2440 показало, що найбільш пригнічувальну дію проявили актинобактерії до грампозитивної бактерії – Kocuria rhizophila DSM 348. Більш стійким тест-штамом, який не піддався пригніченню є грамнегативна бактерія – Рseudomonas putidа KT 2440. Біоінформатичний аналіз показав наявність кластерів NRPS. В штамах Streptomyces ambofaciens Myt7b, Streptomyces ambofaciens ONU 561 були виявлені унікальні біосинтетичні кластери, включно з гібридами NRPS/PKS. Унікальним є кластер, що продукує сидерофор целіхелін. Доменні структури і регуляторні елементи, виявлені в геномах, свідчать про здатність досліджуваних штамів продукувати нові вторинні метаболіти з потенційною антимікробною активністю.
dc.description.abstractActinobacteria of the genus Streptomyces isolated from the Odessa Bay of the Black Sea were studied for the presence of nonribosomal peptide synthetase (NRPS) gene clusters. As a result, gene clusters were identified in the strains Streptomyces ambofaciens Myt7b and Streptomyces ambofaciens ONU 561. The morphological and cultural properties of the strains were also characterized. The study of Actinobacteria strains with NRPS clusters for antagonistic activity against the indicator microorganisms Kocuria rhizophila DSM 348 and Pseudomonas putida KT 2440 showed that Actinobacteria exhibited the strongest inhibitory effect against the Gram-positive bacterium Kocuria rhizophila DSM 348. The Gram-negative bacterium Pseudomonas putida KT 2440 was more resistant and showed no signs of inhibition. Bioinformatic analysis revealed the presence of NRPS clusters. Unique biosynthetic clusters, including NRPS/PKS hybrids, were identified in the strains Streptomyces ambofaciens Myt7b and Streptomyces ambofaciens ONU 561. Among the most significant is the cluster responsible for the production of the siderophore coelichelin. Unique domain structures and regulatory elements discovered in the genomes indicate the capability of the studied strains to produce novel secondary metabolites with potential antimicrobial activity.
dc.identifier.citationГрибов, М. В. Характеристика кластерів генів нерибосомних пептид-синтетаз штамів актинобактерій, ізольованих з поверхонь мідій Чорного моря = Characterization of gene clusters of non-ribosomal peptide-synthetases of actinobacterial strains isolated from the surfaces of mussels of the Black Sea : кваліфікаційна робота магістра / М. В. Грибов. – Одеса, 2024. – 64 с.
dc.identifier.urihttps://dspace.onu.edu.ua/handle/123456789/40674
dc.language.isouk
dc.publisherОдеський національний університет імені І. І. Мечникова
dc.subject091 біологія та біохімія
dc.subjectбіологія
dc.subjectмагістр
dc.subjectнерибосомні пептид-синтетази
dc.subjectнерибосомні пептиди
dc.subjectактинобактерії
dc.subjectсинтез антибіотиків
dc.subjectNRPS
dc.subjectантагоністична активність
dc.subjectnonribosomal peptide-synthetase
dc.subjectnonribosomal peptides
dc.subjectactinobacteria
dc.subjectantibiotic synthesis
dc.subjectantagonistic activity
dc.titleХарактеристика кластерів генів нерибосомних пептид-синтетаз штамів актинобактерій, ізольованих з поверхонь мідій Чорного моря
dc.title.alternativeCharacterization of gene clusters of non-ribosomal peptide-synthetases of actinobacterial strains isolated from the surfaces of mussels of the Black Sea
dc.typeDiplomas
Файли
Контейнер файлів
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
091_Hrybov _Mykyta _Volodymyrovych1.docx
Розмір:
31.43 KB
Формат:
Microsoft Word XML
Завантажити
Ліцензійна угода
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
license.txt
Розмір:
1.71 KB
Формат:
Item-specific license agreed upon to submission
Опис:
Завантажити
Зібрання
Магістри Біолог. ф-т