Comparative analysis of PKS type I in representatives of the genera Basillus and Streptomyces

dc.contributor.authorJunkun Su,
dc.date.accessioned2025-03-10T08:46:17Z
dc.date.available2025-03-10T08:46:17Z
dc.date.issued2024
dc.description.abstractУ дипломній роботі був проведений порівняльний аналіз кластерів полікетид сінтаз першого типу у представників родів Bacillus і Streptomyces. В ході дослідження були знайдені в базах даних послідовності полікетид сінтаз першого типу і проведено філогенетичний аналіз. Додатково було побудовано теплову карту для проведення порівняння структури кластерів полікетид сінтаз першого типу у представників родів Bacillus і Streptomyces. Було показано, що за первинними послідовностямі амінокислот усі знайдені кластери полікетид сінтаз першого типу у представників роду Streptomyces є монофілетичною групою. Послідовності послікетид синтаз у представників роду Bacillus є більш диференційованими. Аналіз отриманої теплової карти показав, що для найбільш важливими для диференціації полікетид сінтаз першого типу у представників роду Bacillus є домени Unknowm domain і KS домени. У передставнків Streptomyces найбільш важливими для диференціації полікетид сінтаз першого типу є домени AT and KS.
dc.description.abstractIn the thesis, a comparative analysis of type I polyketide synthase clusters in representatives of the Bacillus and Streptomyces genera was conducted. During the study, sequences of type I polyketide synthases were found in databases and a phylogenetic analysis was performed. Additionally, a heat map was constructed to compare the structure of type I polyketide synthase clusters in representatives of the Bacillus and Streptomyces genera. It was shown that according to the primary amino acid sequences, all found type I polyketide synthase clusters in representatives of the Streptomyces genus are a monophyletic group. Sequences of polyketide synthases in representatives of the Bacillus genus are more differentiated. Analysis of the resulting heat map showed that the most important for the differentiation of type I polyketide synthases in representatives of the Bacillus genus are the Unknown domain and KS domains. In representatives of Streptomyces, the most important for the differentiation of type I polyketide synthases are the AT and KS domains.
dc.identifier.citationJunkun Su. Comparative analysis of PKS type I in representatives of the genera Basillus and Streptomyces = Порівняльний аналіз ПКС першого типу у представників родів Basillus і Streptomyces : qualification work (thesis) for «Master» / Junkun Su. – Odesa, 2024. – 69 P.
dc.identifier.urihttps://dspace.onu.edu.ua/handle/123456789/40759
dc.language.isoen
dc.publisherОдеський національний університет імені І. І. Мечникова
dc.subject162 Biotechnologies and bioengineering
dc.subjectмагістр
dc.subjectBacillus
dc.subjectStreptomyces
dc.subjectполікетидсинтази типу І
dc.subjectфілогенетичний аналіз
dc.subjectpolyketide synthases type I
dc.subjectphylogenetic analysis
dc.titleComparative analysis of PKS type I in representatives of the genera Basillus and Streptomyces
dc.title.alternativeПорівняльний аналіз ПКС першого типу у представників родів Basillus і Streptomyces
dc.typeDiplomas
Файли
Контейнер файлів
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
162_Junkun_Su1.docx
Розмір:
33.55 KB
Формат:
Microsoft Word XML
Ліцензійна угода
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
license.txt
Розмір:
1.71 KB
Формат:
Item-specific license agreed upon to submission
Опис: