Визначення ролі водневих зв’язків у формуванні кристалів купрум (II) 1,10-фенантролін гідроксикарбоксилатогерманатів методом поверхонь Хіршфельда

dc.contributor.authorЧебаненко, Олена Анатоліївнаuk
dc.contributor.authorБучко, О. В.uk
dc.contributor.authorАфанасенко, Елеонора Вадимівнаuk
dc.contributor.authorСейфулліна, Інна Йосипівнаuk
dc.contributor.authorМарцинко, Олена Едуардівнаuk
dc.contributor.authorЧебаненко, Елена Анатольевнаru
dc.contributor.authorБучко, О. В.ru
dc.contributor.authorАфанасенко, Элеонора Вадимовна ru
dc.contributor.authorСейфуллина, Инна Иосифовнаru
dc.contributor.authorМарцинко, Елена Эдуардовнаru
dc.contributor.authorChebanenko, Olena Anatoliivnaen
dc.contributor.authorBuchko, O. V.en
dc.contributor.authorAfanasenko, Eleonora V.en
dc.contributor.authorSeifullina, Inna Y.en
dc.contributor.authorMartsynko, Olena E.en
dc.date.accessioned2021-04-13T07:08:00Z
dc.date.available2021-04-13T07:08:00Z
dc.date.issued2021
dc.description.abstractПредставлена робота присвячена дослідженню міжмолекулярних взаємодій комплексних сполук катіон-аніонного типу [Cu(Phen)2Cl]2[Ge(HCit)2]⋅6H2O (I), [Cu(Phen)3]2[Ge2(OH)(HTart)(μ-Tart) 2]·11H2O (II), [CuCl(Phen)2]4[{Ge2(OH)2(μ-Tart) 2}Cl2]·4Н2О (III), [Cu(Phen)3]2[(OH)2Ge2(μ-HXylar) 4Ge2(μ-OH) 2]·8H2O (IV), [CuCl(Phen)2]4[(OH)2Ge2(μ-HXylar) 4Ge2(μ-OH) 2]·8H2O (V) методом поверхонь Хіршфельда. Встановлено, що в складі сполук спостерігаються різні типи водневих взаємодій: біфуркатні, симетричні О-Н…О, С-Н…С та несиметричні за участю молекул води. Двовимірні гістограми, 2D‑розгортки поверхонь Хіршфельда дозволили кількісно оцінити зв’язки в кристалах, та встановити, що найбільший внесок в загальну площу поверхонь гідроксикарбоксилатогерманатних аніонів сполук I–V вносять зв’язки H…O/O…H та контакти H…H. Визначальним для формування кристалів виявилась присутність великої кількості молекул кристалізаційної води, що приймають участь в утворенні складної системи водневих зв’язків та зміцнюють структуру, яка в іншому випадку була б нестійкою через великі розміри катіонів та аніонів.uk_UA
dc.description.abstractПредставленная работа посвящена исследованию особенностей кристаллических структур комплексных соединений [Cu(phen)2Cl]2[Ge(HCit)2]⋅6H2O (I), [Cu(Phen)3]2[Ge2(OH) (HTart)(μ-Tart) 2]·11H2O (II), [CuCl(Phen)2]4[{Ge2(OH)2(μ-Tart) 2}Cl2]·4Н2О (III), [Cu(Phen)3]2[(OH)2Ge2(μ-HXylar) 4Ge2(μ-OH) 2]·8H2O (IV), [CuCl(Phen)2]4[(OH)2Ge2(μ-HXylar) 4Ge2(μ-OH) 2]·8H2O (V) методом поверхностей Хиршфельда, который рассма- тривает молекулы как целостные структуры и является эффективным инструментом для анализа межмолекулярных взаимодействий, таких как водородные связи и более слабые C…H и С…Н…p. Для каждого из соединений I–V было построено трехмерную картину тесных контактов в кристалле, на которой короткие контакты окрашены красным цветом, а другие, более слабые и длинные – светлые области и небольшие пятна. Установлено, что в составе комплексов наблюдаются разные типы водородных взаимодействий: бифуркатные, симметричные О-Н…О, С-Н…С и несимметричные с участием молекул воды. Двухмерные гистограммы, 2D‑развертки поверхностей Хиршфельда позволили количественно оценить связи в кристаллах и установить, что наибольший вклад в общую площадь поверхностей гидроксикарбоксилатогерманатных анионов соединений I–V вносят связи H…O/O…H и контакты H…H. Определяющим для формирования кристаллов оказалось присутствие большого количества молекул кристаллизационной воды, которые принимают участие в образовании сложной системы водородных связей и укрепляют структуру, которая в противном случае была бы неустойчивой из-за больших размеров катионов и анионов. Полученные результаты важны для дальнейшего понимания роли водородных связей в процессах кристаллизации, образования кристаллогидратов, электрической диссоциации, и, особенно, растворения в биологических системах.
dc.description.abstractThis article is dedicated to the investigation of crystalline structure in the complex cation-anionic compounds Cu(Phen)2Cl]2[Ge(HCit)2]⋅6H2O (I), [Cu(Phen)3]2[Ge2(OH) (HTart)(μ-Tart) 2]·11H2O (II), [CuCl(Phen)2]4[{Ge2(OH)2(μ-Tart) 2}Cl2]·4Н2О (III), [Cu(Phen)3]2[(OH)2Ge2(μ-HXylar) 4Ge2(μ-OH) 2]·8H2O (IV), [CuCl(Phen)2]4[(OH)2Ge2(μ-HXylar) 4Ge2(μ-OH) 2]·8H2O (V) using Hirshfeld surface analysis. This method has showed itself as an effective tool for analysis of intermolecular interactions, such as hydrogen bonds or weaker C…H and С…Н…p connections. Three-dimensional picture of close interactions in the crystal was built for each of the compounds I–V, where short connections are red-colored, while others – weaker and shorter – are light areas and small spots. It was established that in the structures of all compounds different types of hydrogen bonds are presented: bifurcate connections, symmetrical О-Н…О, С-Н…С and asymmetrical ones with water molecules. Two-dimensional histograms – 2D‑fingerprint plots, allowed to evaluate quantitively connections in the crystals and establish that H…O/O…H and H…H interactions make the biggest contribution to the total surface area. The presence of the big number of crystallization water molecules is determinant for the formation of complex system of hydrogen bonds and strengthening of the structure, that otherwise would be unstable because of the big size of cations and anions. Due to the fact, that all compounds have the same complexing agent Ge (IV), structure of the anion is determined by polydentate ligand. Obtained results are important for the further development of the water role in the processes of crystallization, crystal formation, electrical dissociation and, especially, dissolving of coordination compounds in biological systems.
dc.identifierУДК 541.49:546.814:546.289
dc.identifier.citationВісник Одеського національного університету = Odesa National University Heralduk_UA
dc.identifier.urihttps://dspace.onu.edu.ua/handle/123456789/30780
dc.language.isoukuk_UA
dc.publisherОдеський національний університет імені І. І. Мечниковаuk_UA
dc.relation.ispartofseriesХімія;Т. 26, вип. 1(77).
dc.subjectповерхні Хіршфельдаuk_UA
dc.subjectводневі зв’язкиuk_UA
dc.subjectp-p стекінг взаємодіяuk_UA
dc.subjectгерманійuk_UA
dc.subjectкупрумuk_UA
dc.subjectкоординаційні сполукиuk_UA
dc.subjectцитратна кислотаuk_UA
dc.subjectтартратна кислотаuk_UA
dc.subjectтригідроксиглутарова кислотаuk_UA
dc.subjectповерхность Хиршфельдаuk_UA
dc.subjectводородные связиuk_UA
dc.subjectp-p-стэкинг взаимодействияuk_UA
dc.subjectгерманийuk_UA
dc.subjectкоординационные соединенияuk_UA
dc.subjectцитратная кислотаuk_UA
dc.subjectтартратная кислотаuk_UA
dc.subjectтриоксиглутаровая кислотаuk_UA
dc.subjecthydrogen bondsuk_UA
dc.subjectp-p staking interactionsuk_UA
dc.subjectHirshfeld surfacesuk_UA
dc.subjectgermaniumuk_UA
dc.subjectcopperuk_UA
dc.subjectcoordination compoundsuk_UA
dc.subjectcitric aciduk_UA
dc.subjecttartaric aciduk_UA
dc.subjecttrioxyglutaric aciduk_UA
dc.titleВизначення ролі водневих зв’язків у формуванні кристалів купрум (II) 1,10-фенантролін гідроксикарбоксилатогерманатів методом поверхонь Хіршфельдаuk_UA
dc.title.alternativeИсследование роли водородных связей в образовании купрум (II) 1,10-фенантролинuk_UA
dc.title.alternativeHydrogen bonds in the formation of Copper(II) 1,10-phenanthroline hydroxycarboxylatogermanate crystals using Hirshfeld surface analysisuk_UA
dc.typeArticleuk_UA
Файли
Контейнер файлів
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Вантажиться...
Ескіз
Назва:
85-96.pdf
Розмір:
2.3 MB
Формат:
Adobe Portable Document Format
Опис:
Ліцензійна угода
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
license.txt
Розмір:
1.71 KB
Формат:
Item-specific license agreed upon to submission
Опис: