Дослідження кластерів генів вторинних метаболітів штаму Bacillus subtilis ODLBC-200 ізольованого з Чорного моря

Скорочена інформація про документ
dc.contributor.authorАлександрович, Дмитро Олексійович
dc.date.accessioned2024-10-03T09:46:42Z
dc.date.available2024-10-03T09:46:42Z
dc.date.issued2024
dc.description.abstractВ роботі було досліджено штам Bacillussubtilisstrain ODLBC–200 за допомогою біоінформатичних методів, для визначення кластерів генів,які відповідають за біосинтез вторинних метаболітів з використанням програм BAGEL4, CARD та antiSMASH було виявлено 15 кластерів генів, серед яких зустрічаються кластери нерибосомальних пептидних синтетаз, полікетидсинтаз та гібридні кластери, що здатні до синтеза сполук з різноманітною біологічною активністю. Анотацію генома штамуBacillussubtilisstrainODLBC–200 було проведено з використанням серверів RAST, PATRIK, DFAST, індентичність нуклеотидів (OrthoANI). З використанням TYGS та ОrthoANI проведено філогенетичний аналіз штаму та визначено ідентичність нуклеотидів між найближчими геномами. Дипломнуроботу «Дослідження кластерів генів вторинних метаболітів штаму Bacillussubtilisstrain ODLBC–200 ізольованого з Чорного моря " викладено на 99 сторінахдрукованого тексту вона включає 32 рисункита 10таблиць. Наведено посилання на 98 джерел літератури.
dc.description.abstractIn the work, the Bacillus subtilis strain ODLBC–200 was investigated using bioinformatics methods to determine gene clusters responsible for the biosynthesis of secondary metabolites using the BAGEL4, CARD and antiSMASH programs. 15 gene clusters were found, among which there are clusters of non–ribosomal peptide synthetases, polyketide synthases and hybrid clusters capable of synthesizing compounds with various biological activities. Genome annotation of Bacillus subtilis strain ODLBC–200 was carried out using RAST, PATRIK, DFAST servers. nucleotide identity (OrthoANI). Using TYGS and OrthoANI, a phylogenetic analysis of the strain was performed and nucleotide identity between the nearest genomes was determined. The thesis "Study of gene clusters of secondary metabolites of Bacillus subtilis strain ODLBC–200 isolated from the Black Sea" is laid out on 99 pages of printed text, it includes 32 figures and 10 tables. References to 98 literature sources are given..
dc.identifier.citationАлександрович, Д. О. Дослідження кластерів генів вторинних метаболітів штаму Bacillus subtilis ODLBC-200 ізольованого з Чорного моря = Study of gene clusters of secondary metabolites of Bacillus subtilis strain ODLBC-200 isolated from the Black Sea : дипломна робота бакалавра / Д. О. Александрович. – Одеса, 2024. – 99 с.
dc.identifier.urihttps://dspace.onu.edu.ua/handle/123456789/39369
dc.language.isouk
dc.publisherОдеський національний університет імені І. І. Мечникова
dc.subject162 біотехнології та біоінженерія
dc.subjectбакалавр
dc.subjectBacillussubtili
dc.subjectкластери генів
dc.subjectанотація геномів
dc.subjectвторинні метаболіти
dc.subjectgene clusters
dc.subjectgenome annotation
dc.subjectsecondary metabolites
dc.titleДослідження кластерів генів вторинних метаболітів штаму Bacillus subtilis ODLBC-200 ізольованого з Чорного моря
dc.title.alternativeStudy of gene clusters of secondary metabolites of Bacillus subtilis strain ODLBC-200 isolated from the Black Sea
dc.typeDiplomas
Файли
Контейнер файлів
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
162_Aleksandrovych_Dmytro _Oleksiyovych1.docx
Розмір:
54.63 KB
Формат:
Microsoft Word XML
Завантажити
Ліцензійна угода
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
license.txt
Розмір:
1.71 KB
Формат:
Item-specific license agreed upon to submission
Опис:
Завантажити
Зібрання
Бакалаври Біолог. ф-т