Оцінка потенціалу морських спороутворюючих бактерій у біозахисті рослин за допомогою біоінформатичного аналізу
Ескіз недоступний
Дата
2024
Науковий керівник
Укладач
Редактор
Назва журналу
ISSN
E-ISSN
Назва тому
Видавець
Одеський національний університет імені І. І. Мечникова
Анотація
Проведено дослідження здатності споротвірних бактерій, виділених з Чорного моря, до біосинтезу вторинних метаболітів для біозахисту сільськогосподарських культур. З використанням методів повногеномного секвенування та біоінформатичного аналізу у досліджених мікроорганізмів було виявлено здатність до продукування 13 видів вторинних метаболітів, активних щодо збудників інфекцій рослин. Найбільшу кількість біосинтетичних генних кластерів, відповідальних за синтез таких сполук, виявлено у геномах клітин штамів виду Bacillus velezensis (9, 8 та 7 кластерів у трьох досліджених штамів). На основі двох досліджених штамів запропоновано технологічну схему виробництва препарату для біологічного захисту сільськогосподарських культур.
The ability of spore-forming bacteria isolated from the Black Sea to biosynthesis of secondary metabolites for the bioprotection of agricultural crops was studied. Using methods of whole-genome sequencing and bioinformatics analysis, the ability of the studied microorganisms to produce 13 types of secondary metabolites active against pathogens of plant infections was revealed. The largest number of biosynthetic gene clusters responsible for the synthesis of such compounds was found in the genomes of cells of strains of the species Bacillus velezensis (9, 8 and 7 clusters in 3 investigated strains). Based on the two studied strains, a technological scheme for the production of a preparation for the biological protection of agricultural crops was proposed.
The ability of spore-forming bacteria isolated from the Black Sea to biosynthesis of secondary metabolites for the bioprotection of agricultural crops was studied. Using methods of whole-genome sequencing and bioinformatics analysis, the ability of the studied microorganisms to produce 13 types of secondary metabolites active against pathogens of plant infections was revealed. The largest number of biosynthetic gene clusters responsible for the synthesis of such compounds was found in the genomes of cells of strains of the species Bacillus velezensis (9, 8 and 7 clusters in 3 investigated strains). Based on the two studied strains, a technological scheme for the production of a preparation for the biological protection of agricultural crops was proposed.
Опис
Ключові слова
162 біотехнології та біоінженерія, магістр, споротвірні бактерії, повногеномне секвенування, бази даних, біологічний захист рослин, spore-forming bacteria, whole genome sequencing, databases, plant bioprotection
Бібліографічний опис
Кружиліна, В. В. Оцінка потенціалу морських спороутворюючих бактерій у біозахисті рослин за допомогою біоінформатичного аналізу = Evaluation of the potential of marine spore-forming bacteria in plant bioprotection by bioinformatic analysis : кваліфікаційна робота магістра / В. В. Кружиліна. – Одеса, 2024. – 44 с.