Дослідження кластерів генів вторинних метаболітів штаму Bacillus subtilis 200a, ізольованого з донних відкладень Чорного моря
Ескіз недоступний
Дата
2024
Автори
Науковий керівник
Укладач
Редактор
Назва журналу
ISSN
E-ISSN
Назва тому
Видавець
Одеський національний університет імені І. І. Мечникова
Анотація
У роботі досліджено геноми штамів Bacillus subtilis 168, B. subtilis 220а та B. subtilis PS-68 з метою ідентифікації та порівняння біосинтетичних генних кластерів, відповідальних за синтез біологічно активних метаболітів. Ідентифіковано 16 кластерів, включно з sactipeptide, ranthipeptide, transAT- PKS, T3PKS, NRPS, betalactone, NRP-metallophore, CDPS, sporulation killing factor, сурфактином, бациленом, фенгіцином, бацилибактином, пульхериміновою кислотою, субтилозином А та бацилізином.
Проведено порівняльний аналіз розмірів, структури та організації кластерів, що виявив суттєві відмінності між штамами. Зокрема, штам B. subtilis PS-68 характеризується компактними регіонами та унікальними генетичними особливостями, адаптованими до водного середовища. Досліджено вплив відсутності транспортних та регуляторних кластерів на функціонування біосинтетичних регіонів у B. subtilis PS-68.
The work investigated the genomes of strains Bacillus subtilis 168, B. subtilis 220a and B. subtilis PS-68 were sequenced to identify and compare biosynthetic gene clusters responsible for the synthesis of biologically active metabolites. 16 clusters were identified, including sactipeptide, ranthipeptide, transAT-PKS, T3PKS, NRPS, betalactone, NRP-metallophore, CDPS, sporulation killing factor, surfactin, bacillen, fengycin, bacillibactin, pulcherimic acid, subtylosin A and bacillisin. A comparative analysis of the size, structure and organization of the clusters was carried out, which revealed significant differences between the strains. In particular, the strain B. subtilis PS-68 is characterized by compact regions and unique genetic features adapted to the aquatic environment. The effect of the absence of transport and regulatory clusters on the functioning of biosynthetic regions in B. subtilis PS-68 was investigated.
The work investigated the genomes of strains Bacillus subtilis 168, B. subtilis 220a and B. subtilis PS-68 were sequenced to identify and compare biosynthetic gene clusters responsible for the synthesis of biologically active metabolites. 16 clusters were identified, including sactipeptide, ranthipeptide, transAT-PKS, T3PKS, NRPS, betalactone, NRP-metallophore, CDPS, sporulation killing factor, surfactin, bacillen, fengycin, bacillibactin, pulcherimic acid, subtylosin A and bacillisin. A comparative analysis of the size, structure and organization of the clusters was carried out, which revealed significant differences between the strains. In particular, the strain B. subtilis PS-68 is characterized by compact regions and unique genetic features adapted to the aquatic environment. The effect of the absence of transport and regulatory clusters on the functioning of biosynthetic regions in B. subtilis PS-68 was investigated.
Опис
Ключові слова
091 біологія, мікробіологія і вірусологія, магістр, Bacillus, Bacillus subtilis, кластери, вторинні метаболіти, clusters, secondary metabolites
Бібліографічний опис
Місевич, А. Ю. Дослідження кластерів генів вторинних метаболітів штаму Bacillus subtilis 200a, ізольованого з донних відкладень Чорного моря = Study of gene clusters of secondary metabolites of Bacillus subtilis 200a strain isolated from Black Sea sediments : кваліфікаційна робота магістра / А. Ю. Місевич. – Одеса, 2024. – 62 с.