Характерные особенности KEY-подобных бактериофагов Erwinia amylovora
Вантажиться...
Дата
2017
Науковий керівник
Укладач
Редактор
Назва журналу
ISSN
E-ISSN
Назва тому
Видавець
Одеський національний університет імені І. І. Мечникова
Анотація
Цель. Изучить гетерогенность фагового изолята, полученного из груш, пораженных Erwinia amylovora. Методы. Гетерогенность фаговых изолятов изучали с использыванием ионообменной хроматографии низкого давления (LPLC), электронно-микроскопического анализа вирионов и рестрикционного анализа ДНК. В работе использовали бактериофаги KEY, KEY/7 и
KEY/25. Результаты. Показано, что изолят содержит двухкомпонентную популяцию KEY-подобных фагов, частицы которых различаются по сродству к DEAE-целлюлозе. Фаги обеих субпопуляций представлены вирионами В1-морфотипа (семейство Siphoviridae) с правильными икосаэдрическими капсидами диаметром около 77 нм и длиной хвостовых отростков, близкой к 172 нм. Эти фаговые частицы по морфологии и размеру близки к таковым прототипного фага KEY. По данным рестрикционного анализа геномы фагов чистых линий KEY/7 и KEY/25 близки между собой и имеют размеры около 72 кб, что на 25–27% меньше, чем размер генома фага KEY. Предполагается, что фаги KEY/7 и KEY/25 представляют собой делеционные варианты фага KEY. Вывод. Гетерогенность фаговых изолятов, полученных из пораженных растений, имеет две ключевые характеристики: изменение
сродства частиц к DЕАЕ-целлюлозе и генетической структуры их генома.
Дальнейшие исследования как фаговых изолятов так и фаговых популяций
важны для изучения экологии и возможности использования бактериофагов для биоконтроля опасных патогенов древесных растений.
Мета. Вивчити гетерогенність фагового ізоляту, що був одержаний з гілок та листя груші, уражених Erwinia amylovora. Методи. Гетерогенність фагових ізолятів вивчали з використанням системи, котра включала себе йонообмінну хроматографію низького тиску (LPLC), електронно-мікроскопічний аналіз віріонів і рестрикційний аналіз ДНК. В роботі були використані бактеріофаги KEY, KEY/7 і KEY/25. Результати. Ізолят містить двохкомпонентну популяцію KEY-подібних фагів, частки яких розрізняються за спорідненістю до DEAE-целюлози. Фаги обох субпопуляцій представлені віріонами В1морфотипу (родина Siphoviridae) із правильними ікосаедричними капсидами діаметром близько 77 нм та довжиною хвостових відростків, близькою до 172 нм. Ці фагові частки за морфологією та розміром подібні до таких прототипного фага KEY. За даними рестрикційоного аналізу геноми фагів чистих ліній KEY/7 та KEY/25 подібні та мають розмір близько 72 кб, що на 25–27% менше, ніж розмір геному фага KEY. Припускається, що фаги KEY/7 та KEY/25 являють собою делеційні варіанти фага KEY. Висновок. Гетерогенність фагових ізолятів, отриманих з уражених рослин, має дві ключові характеристики: змінення спорідненості часток до DЕАЕ-целлюлози і генетичної структури їх геному. Подальші дослідження як фагових ізолятів так і фагових популяцій важливі для вивчення екології та можливості використання бактеріофагів для біоконторолю небезпечних патогенів деревних рослин.
Aim. To study the heterogeneity of phage isolates obtained from twigs and leaves of pear affected with Erwinia amylovora. Methods. The heterogeneity of phage isolates was studied using the system included low pressure liquid chromatography (LPLC), electron-microscopy analysis of virions and DNA restriction analysis. In this work, the bacteriophages KEY, KEY/7 and KEY/25 were used. Results. the isolate contains a two-component population of KEY-like phage particles, which differ in affinity for DEAE-cellulose. Phages of both subpopulations are represented by virions of B1 morphotype (Siphoviridae family) with regular icosahedral capsids with the diameter of about 77 nm and the length of the caudal appendages close to 172 nm. These phage particles are similar to those of the prototype KEY phage in morphology and size. According to the restriction analysis data, the genomes of the pure line phages KEY/7 and KEY/25 are similar to each other and have the size of about 72 kb, which is 25–27% less than the size of the genome of KEY phage. It is assumed that the phages KEY/7 and KEY/25 represent deletion variants of KEY phage. Conclusions. The heterogeneity of phage isolates get from damaged plants have two main characteristics:the changes of affinity of particles to DEAE-cellulose and the changes of genetic structure of its genome. Further research both phage isolates and phage population are important for study of ecology and opportunity of phage using for biocontrol of dangerous woody plants pathogens.
Мета. Вивчити гетерогенність фагового ізоляту, що був одержаний з гілок та листя груші, уражених Erwinia amylovora. Методи. Гетерогенність фагових ізолятів вивчали з використанням системи, котра включала себе йонообмінну хроматографію низького тиску (LPLC), електронно-мікроскопічний аналіз віріонів і рестрикційний аналіз ДНК. В роботі були використані бактеріофаги KEY, KEY/7 і KEY/25. Результати. Ізолят містить двохкомпонентну популяцію KEY-подібних фагів, частки яких розрізняються за спорідненістю до DEAE-целюлози. Фаги обох субпопуляцій представлені віріонами В1морфотипу (родина Siphoviridae) із правильними ікосаедричними капсидами діаметром близько 77 нм та довжиною хвостових відростків, близькою до 172 нм. Ці фагові частки за морфологією та розміром подібні до таких прототипного фага KEY. За даними рестрикційоного аналізу геноми фагів чистих ліній KEY/7 та KEY/25 подібні та мають розмір близько 72 кб, що на 25–27% менше, ніж розмір геному фага KEY. Припускається, що фаги KEY/7 та KEY/25 являють собою делеційні варіанти фага KEY. Висновок. Гетерогенність фагових ізолятів, отриманих з уражених рослин, має дві ключові характеристики: змінення спорідненості часток до DЕАЕ-целлюлози і генетичної структури їх геному. Подальші дослідження як фагових ізолятів так і фагових популяцій важливі для вивчення екології та можливості використання бактеріофагів для біоконторолю небезпечних патогенів деревних рослин.
Aim. To study the heterogeneity of phage isolates obtained from twigs and leaves of pear affected with Erwinia amylovora. Methods. The heterogeneity of phage isolates was studied using the system included low pressure liquid chromatography (LPLC), electron-microscopy analysis of virions and DNA restriction analysis. In this work, the bacteriophages KEY, KEY/7 and KEY/25 were used. Results. the isolate contains a two-component population of KEY-like phage particles, which differ in affinity for DEAE-cellulose. Phages of both subpopulations are represented by virions of B1 morphotype (Siphoviridae family) with regular icosahedral capsids with the diameter of about 77 nm and the length of the caudal appendages close to 172 nm. These phage particles are similar to those of the prototype KEY phage in morphology and size. According to the restriction analysis data, the genomes of the pure line phages KEY/7 and KEY/25 are similar to each other and have the size of about 72 kb, which is 25–27% less than the size of the genome of KEY phage. It is assumed that the phages KEY/7 and KEY/25 represent deletion variants of KEY phage. Conclusions. The heterogeneity of phage isolates get from damaged plants have two main characteristics:the changes of affinity of particles to DEAE-cellulose and the changes of genetic structure of its genome. Further research both phage isolates and phage population are important for study of ecology and opportunity of phage using for biocontrol of dangerous woody plants pathogens.
Опис
Ключові слова
гетерогенность фаговой популяции, КЕY-подобные бактериофаги, Erwinia amylovora, гетерогенність фагової популяції, КЕY-подібні бактеріофаги, Erwinia amylovora, phage population heterogeneity, КЕY-like bacteriophages, Erwinia amylovora
Бібліографічний опис
Мікробіологія і Біотехнологія = Microbiology & Biotechnology