Характеристика кластерів генів PKS I та PKS II штамів актинобактерій, ізольованих з біологічних обростань Одеської затоки Чорного моря

dc.contributor.authorСторожук, Наталя Віталіївна
dc.date.accessioned2025-03-04T11:20:14Z
dc.date.available2025-03-04T11:20:14Z
dc.date.issued2024
dc.description.abstractУ даному дослідженні проведено аналіз біосинтетичних генних кластерів (BGCs) полікетидсинтаз I типу (PKS I) та II типу (PKS II) у штамів Streptomyces ambofaciens Myt7b та Streptomyces ambofaciens ONU 561, ізольованих з біологічних обростань Одеської затоки Чорного моря. Для цього були використані біоінформатичні інструменти, доступні в програмному комплексі antiSMASH, з метою виявлення та характеристики цих кластерів і прогнозування їхнього потенціалу щодо синтезу біологічно активних сполук. Результати показали значну схожість Streptomyces ambofaciens Myt7b з відомими видами, здатними синтезувати такі цінні сполуки, як ентероцин, кураміцин та інтоміцин В. Аналіз доменної структури геному Streptomyces ambofaciens ONU 561 показав подібність генетичних кластерів до штамів, які продукують кандицидин і кураміцин. Ці результати підкреслюють потенціал зазначених штамів для синтезу природних продуктів, які можуть бути корисними в біотехнології та медицині.
dc.description.abstractIn this study, the biosynthetic gene clusters (BGCs) of type I (PKS I) and type II (PKS II) polyketide synthases in in Streptomyces ambofaciens Myt7b and Streptomyces ambofaciens ONU 561 strains isolated from biological fouling of the Odesa Bay of the Black Sea. For this purpose, bioinformatics tools available in the antiSMASH software package were used to identify and characterize these clusters and predict their potential for the synthesis of biologically active compounds. The results showed significant similarity of Streptomyces ambofaciens Myt7b to known species capable of synthesizing such valuable compounds as enterocin, curamycin and intomycin B. Analysis of the domain structure of the genome of Streptomyces ambofaciens ONU 561 showed similarity of genetic clusters to strains producing candicidin and curamycin. These results emphasize the potential of these strains for the synthesis of natural products that may be useful in biotechnology and medicine.
dc.identifier.citationСторожук, Н. В. Характеристика кластерів генів PKS I та PKS II штамів актинобактерій, ізольованих з біологічних обростань Одеської затоки Чорного моря = Characterization of PKS I and PKS II gene clusters of actinobacteria strains isolated from the biological fouling of the Black Sea : кваліфікаційна робота магістра / Н. В. Сторожук. – Одеса, 2024. – 75 с.
dc.identifier.urihttps://dspace.onu.edu.ua/handle/123456789/40715
dc.language.isouk
dc.publisherОдеський національний університет імені І. І. Мечникова
dc.subject091 біологія та біохімія
dc.subjectмікробіологія та вірусологія
dc.subjectмагістр
dc.subjectАctinomycete
dc.subjectполікетидсинтази (PKS)
dc.subjectЧорне море
dc.subjectОдеська затока
dc.subjectвторинні метаболіти
dc.subjectбіосинтетичні генні кластери
dc.subjectantiSMASH
dc.subjectантибіотики
dc.subjectpolyketide synthases (PKS)
dc.subjectBlack Sea
dc.subjectOdesa Bay
dc.subjectsecondary metabolites
dc.subjectbiosynthetic gene clusters
dc.subjectantibiotics
dc.titleХарактеристика кластерів генів PKS I та PKS II штамів актинобактерій, ізольованих з біологічних обростань Одеської затоки Чорного моря
dc.title.alternativeCharacterization of PKS I and PKS II gene clusters of actinobacteria strains isolated from the biological fouling of the Black Sea
dc.typeDiplomas
Файли
Контейнер файлів
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
091_Storozhuk_Natalya_Vitaliyivna1.docx
Розмір:
47.22 KB
Формат:
Microsoft Word XML
Ліцензійна угода
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
license.txt
Розмір:
1.71 KB
Формат:
Item-specific license agreed upon to submission
Опис: