Перегляд за Автор "Babenko, Dmytro O."

Зараз показуємо 1 - 8 з 8
  • Ескіз
    Документ
    DETECTION OF PLANTARICIN GENES IN STRAINS OF LACTOBACILLUS PLANTARUM – ANTAGONISTS OF PHYTOPATHOGENIC BACTERIA
    (Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2015) Limanska, Nataliia V.; Babenko, Dmytro O.; Yamborko, Hanna V.; Ivanytsia, Volodymyr O.; Ліманська, Наталія Вікторівна; Бабенко, Дмитро Олександрович; Ямборко, Ганна Валентинівна; Іваниця, Володимир Олексійович; Лиманская, Наталия Викторовна; Бабенко, Дмитрий Александрович; Ямборко, Анна Валентиновна; Иваница, Владимир Алексеевич
    The aim of investigation was to detect the presence of genes responsible for bacteriocin synthesis in strains of Lactobacillus plantarum with the clear antagonistic effect against the gram-negative phytopathogens. Methods. To reveal eleven genes involved in plantaricin synthesis the polymerase chain reaction was used. To test the ability to synthesize bacteriocins as antagonistic compounds the experiments with the lawns of test-strains Listeria ivanovii INRA, Rhizobium radiobacter C58, Ralstonia solanacearum B-1109-UCM, Erwinia carotovora ZM1, Rhizobium vitis OНУ 389, R. vitis OНУ 388, R. vitis 379 and R. rhizogenes 15834 were used. Results. In genomes of the tested L. plantarum strains the genes plnD, plnEF, plnG, plnI, plnN were present, but the genes plnA, plnB, plnC, plnW were not revealed. Applying the cultural liquids of lactobacilli on the lawns of the test-strains has shown that the cell-free cultural liquid with the initially low pH (4.1–4.3) caused the zones of growth inhibition on the lawns of all test-strains. The neutralized cell-free cultural liquid did not affect the growth of the test-strains. Conclusion. Although the tested strains L. plantarum ОNU 87, L. plantarum ОNU 206 and L. plantarum ОNU 991 possessed some genes of plantaricin regulon, in the investigations in vitro they caused the inhibition of the phytopathogens and listerias due to the low pH of the cell-free cultural liquids but not due to the synthesis of bacteriocins. The combination of the genes of plantaricin regulon of L. plantarum ONU 206 and L. plantarum ONU 991 resembled that in L. plantarum J23 described in literature.
  • Ескіз
    Документ
    Determination of strain Bacillus megaterium onu 500 larvicidal activity against mushrooms pest Bradysia pilistriata frey (sciaridae)
    (Odesa I. I. Mechnikov National University, 2016) Babenko, Dmytro O.; Krylova, K. D.; Uzhevska, Svitlana P.; Ivanytsia, Volodymyr O.; Іваниця, Володимир Олексійович
    It is known that microbial drugs are successfully used in fighting with insect pests. In most cases active components of such drugs are presented by entomopathogenic bacteria of the genus Bacillus and products of their metabolism. The positive features of such drugs are selective activity against insect pests and safety for human and environment.
  • Ескіз
    Документ
    Identification of bacillary microbial contaminants and food poisoning agents from Ukrainian plant raw materials and products
    (2017) Pylypenko, Inna; Pylypenko, Liudmyla; Yamborko, Hanna V.; Ilyeva, Olena; Kotlyar, Evgeniy; Babenko, Dmytro O.; Ямборко, Ганна Валентинівна; Ямборко, Анна Валентиновна; Пилипенко, Інна; Пилипенко, Людмила; Ільєва, Олена; Котляр, Євгеній; Бабенко, Дмитро Олександрович
    Introduction. The characteristics of biological contaminants occurring in plant food products, such as foodborne infections and poisonings, causative agents of spoilage, accelerated indication of potential danger to the consumer are of scientific and practical importance. Materials and methods. A row of widespread and industrially grown kinds of vegetables, fruits, berries and a number of canned and dried products and spices were investigated. Morphological, cultural and biochemical properties of the isolated cultures were studied by conventional methods. Polymerase chain reaction (PCR) was performed using groupspecific and species-specific primers to bacillary sequences with electrophoresis of PCR products in 1.5% agarose gel. Results and discussion.Bacillary microbial contaminants and potential causative agents of food poisoning and food spoilage, which are common in industrially processed types of vegetable raw materials (vegetables, fruits, berries and products of their processing) in Ukraine, have been investigated. The dominance of the subtilis-licheniformis morphotypes of the order Bacillales among the detected rod-shaped spore-forming microorganisms is a feature of the Ukrainian vegetative raw materials. The composition of microbiota of various types of vegetable raw materials and products of their processing were studied by the complex of their phenotypic and moleculargenetic properties. The long duration and potential inaccuracy of identification of aerobic and facultative-anaerobic spore-forming bacteria by the complex of their phenotypic properties has been showed. The method of preparation of food samples and PCR with group-specific and species-specific primers for speeding-up diagnostics of B. cereus, Paenibacillus polymyxa, P. macerans strains in samples have been tested. Contamination of samples of plant raw materials and products of their processing by epidemiologically significant microorganism B. cereus were examined, and showed levels from 16.7% in fresh fruits to 72.7% in spices from the total number of samples. Conclusions. The bacillary microbial contaminants were identified and a speeded up method of food samples preparation for PCR to detect regulated bacillary microorganisms that affect product safety was tested.
  • Ескіз
    Документ
    Lactobacillus plantarum from berries of grape cultivated in the South of Ukraine
    (Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2013) Merlich, Andrii H.; Ivanytsia, Volodymyr O.; Korotaieva, Nadiia V.; Zlatogurska, M. A.; Vasylieva, Nataliia Yu.; Babenko, Dmytro O.; Limanska, Nataliia V.; Мерліч, Андрій Геннадійович; Іваниця, Володимир Олексійович; Коротаєва, Надія Володимирівна; Златогурська, M. A.; Васильєва, Наталія Юріївна; Бабенко, Дмитро Олександрович; Ліманська, Наталія Вікторівна; Мерлич, Андрей Геннадиевич; Иваница, Владимир Алексеевич; Коротаева, Надежда Владимировна; Златогурская, М. А.; Васильева, Наталия Юрьевна; Бабенко, Дмитрий Александрович; Лиманская, Наталия Викторовна
    The aim of the investigation was the isolation of Lactobacillus plantarum from berries of grape and the study of their genetic diversity. Materials and Methods. Lactic acid bacteria were isolated from berries of 14 grape cultivars grown in the south of Ukraine. PCR-assay and RAPD-PCR were used for L. plantarum Identification and the study of their diversity. The reconstruction of phylogenetic tree of the studied strains was carried out with Matlab 7.0 program. Results. Lactobacilli have been isolated from 7 samples of must among 14 of the tested grape cultivars. 80% of the studied strains belonged to L. plantarum species. Groups of genetic similarity between L. plantarum strains have been revealed. In the phylogenetic tree four clusters of the strains grouped by their similarity were formed. The mentioned results allowed to conclude that L. plantarum strains from must of grape of different cultivars and territories of grape cultivation could show the genetic similarity. Opposite, some L. plantarum strains from one source of origin could demonstrate the genetic diversity.
  • Ескіз
    Документ
    NEW ALLELE OF PPD-D1 GENE IN AEGILOPS TAUSCHIIACCESSIONS
    (Печатний дом, 2011) Chebotar, Galyna O.; Chebotar, Sabina V.; Babenko, Dmytro O.; Sivolap, Yu.; Чеботар, Галина Олександрівна; Чеботар, Сабіна Віталіївна
    Photoperiod has an important effect on plant growth and development. Ppd-Dl(2DS) is the one of most potent genes affecting the photoperiod response of wheat(Triticum aestivum).Aegilops tauschii is the D genome donor species for wheat. Several research works were carried out to investigate structure, distribution, evolution and relationships of Ppd-Dl gene with major agronomic traits (Beales et al., 2007; Yang et al., 2008; Guo et al., 2010). According to these works Ppd-Dl gene was sequenced and 6 alleles were revealed. Among these alleles only the deletion of2089 bp upstream the coding region is associated with photoperiod insensitivity - allele Ppd-Dla.
  • Ескіз
    Документ
    Seeds germination and seedlings growth stimulation using Bacillus species
    (2015) Babenko, Dmytro O.
    Bacillus species are widely used for biological preparations creation, because of their sporulation ability and broad metabolic potential. Besides of the antibiotic and entomopathogenic toxins production activity, it was established that these bacteria can synthesize plant growth stimulants and regulators. It has been shown that seeds, seedlings and soil inoculation by microorganisms that belong to different genera, frequently enhances plant growth.
  • Ескіз
    Документ
    Алелі гена Ppd-D1 у зразках колекції Aegilops tauschii і м’якої пшениці
    (2012) Чеботар, Галина Олександрівна; Чеботар, Сабіна Віталіївна; Бабенко, Дмитро Олександрович; Моцний, І. І.; Щербань, А. Б.; Сиволап, Ю. М.; Chebotar, Galyna O.; Chebotar, Sabina V.; Babenko, Dmytro O.; Motsnyi, I. I.; Shcherban, A. B.; Syvolap, Yu. M.; Чеботарь, Галина Александровна; Чеботарь, Сабина Витальевна; Бабенко, Дмитрий Александрович; Моцный, И. И.; Щербань, А. Б.; Сиволап, Ю. М.
    Світловий період суттєво впливає на ріст і розвиток рослин. Одним із головних генів чутливості до фотоперіоду є Ppd-Dl з родина PRR, розташований на хромосомі 2D. Мета роботи поляга ла у визначенні алельного стану і молекулярної структури гена Ppd-D 1 у зразках з колекції Ае. tauschii з різними строками цвітіння та у 29 українських сортів м ’я ко ї пшениці. Методи. Алель-специфічна ПЛР з праймерами до гена Ppd-Dl, секвенування і Blast-аналіз. Результати. Досліджено колекцію зразків Ае. tauschii та низку сортів озимої і яр о ї м ’я ко ї пшениці, визначено молекулярну структуру алельних варіантів (414, 429 і 453 п. н.) гена Ppd-Dl b y колекції Ае. tauschii. Висновки. У досліджуваних сортів озимої м ’якої пшениці присутній алель Ppd-Dla, а серед ярих сортів 60 % відрізняються наявністю алеля P pd-Dlb (розмір продуктів ампліфікації 414 п. н.). Blast-аналізом нуклеотидних послідовностей цього гена з банків даних у порівнянні з референсною послідовністю зразка к-1322 з колекції Ае. tauschii показано високий рівень гомології (від 80 до 100%) між послідовностями генів PRR, характерних для геномів А і D представників родів Triticum і Aegilops.
  • Ескіз
    Документ
    Вплив Lactobacillus plantarum та Bacillus atrophaeus на проростання насіння та ріст проростків пшениці
    (Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2017) Мерліч, Андрій Геннадійович; Ліманська, Наталія Вікторівна; Жунько, Інна Давидівна; Бабенко, Дмитро Олександрович; Мерлич, Андрей Геннадиевич; Лиманская, Наталия Викторовна; Жунько, Инна Давидовна; Бабенко, Дмитрий Александрович; Merlich, Andrii H.; Limanska, Nataliia V.; Zhunko, Inna D.; Babenko, Dmytro O.
    Мета. Вивчення впливу бактерій штамів Lactobacillus plantarum ОНУ12, ОНУ311 та Bacillus atrophaeus ОНУ528 на проростання насіння пшениці та ростові характеристики проростків. Методи. Бактеризація поверхнево простерилізованого насіння розведеними культурами з подальшим пророщуванням в вологих камерах та вимірюванням ростових характеристик проростків. Результати. Обробка L. plantarum ОНУ311 збільшувала довжини коренів проростків на 31% порівняно з контролем та стимулювальний вплив на довжину надземної частини складав 48%. Суміш бактерій штамів L. plantarum ОНУ12 та ОНУ311 збільшувала довжину коренів та надземних частин проростків на 41,1 та 52,4% відповідно, та підвищувала схожість насіння на 25%. Обробка пшениці бактеріями B. atrophaeus ОНУ528 сприяла збільшенню середньої довжини коренів на 39,7% та надземних частин проростків на 45% порівняно з контролем. Висновки. Бактерії L. plantarum, B. atrophaeus та їх суміш проявили стимулювальний вплив як на корені так і на надземні частини проростків пшениці. Вплив лактобактерій залежав як від штамів, використаних в експерименті, так і від концентрацій бактеріальних клітин