Філогенетичний аналіз пропан монооксигенази A (prmA) представників роду Rhodococcus, доступними на NCBI

Скорочена інформація про документ
dc.contributor.authorШургін, Максим Юрійович
dc.date.accessioned2024-10-04T07:52:49Z
dc.date.available2024-10-04T07:52:49Z
dc.date.issued2024
dc.description.abstractДипломна робота «Філогенетичний аналіз пропан монооксигенази А (prmA) представників роду Rhodococcus, доступних на NCBI» є пошуковою. В роботі було проведено філогенетичний аналіз гену prmA представників Rhodococcus. Для уточнення припущення про можливість використання пропанмонооксигенази A (prmA) для мікробіологічної розвідки родовищ нафти та газу провели філогенетичний аналіз послідовностей кластеру генів prmABCD, генів prmA та амінокислотних послідовностей propane monooxygenase (prmA) для підтвердження їх спорідненими між собою. Показано, що проаналізовані послідовності мають показник ідентичності вище 95,0%. Філогенетичні дерева, отримані з використанням алгоритмів множинного вирівнювання ClustalW та MUSCLE, моделей GTR+G+I та WAG+G+I (для нуклеотидних та амінокислотних послідовностей відповідно) та методу Maximum-likelihood підтверджують монофілетичність проаналізованих наборів даних, не залежно від типу послідовності.
dc.description.abstractThe thesis "Phylogenetic analysis of propane monooxygenase A (prmA) of representatives of the genus Rhodococcus available at NCBI" is exploratory. In the work, a phylogenetic analysis of the prmA gene of representatives of Rhodococcus was carried out. To clarify the assumption about the possibility of using propane monooxygenase A (prmA) for microbiological exploration of oil and gas deposits, a phylogenetic analysis of the sequences of the prmABCD gene cluster, prmA genes and amino acid sequences of propane monooxygenase (prmA) was performed to confirm their identity. It is shown that the analyzed sequences have an identity index higher than 95.0%. Phylogenetic trees obtained using ClustalW and MUSCLE multiple alignment algorithms, GTR+G+I and WAG+G+I models (for nucleotide and amino acid sequences, respectively) and the Maximum-likelihood method confirm the monophyletic nature of the analyzed data sets, regardless of sequence type.
dc.identifier.citationШургін, М. Ю. Філогенетичний аналіз пропан монооксигенази A (prmA) представників роду Rhodococcus, доступними на NCBI = Phylogenetic analysis of propane monooxygenase A (prmA) from representatives of the genus Rhodococcus whith prmA available at NCBI : дипломна робота бакалавра / М. Ю. Шургін. – Одеса, 2024. – 67 с.
dc.identifier.urihttps://dspace.onu.edu.ua/handle/123456789/39390
dc.language.isouk
dc.publisherОдеський національний університет імені І. І. Мечникова
dc.subject162 біотехнології та біоінженерія
dc.subjectбакалавр
dc.subjectродовища вуглеводнів
dc.subjectprmA
dc.subjectфілогенетичний аналіз
dc.subjecthydrocarbon deposits
dc.subjectphylogenetic analysis
dc.titleФілогенетичний аналіз пропан монооксигенази A (prmA) представників роду Rhodococcus, доступними на NCBI
dc.title.alternativePhylogenetic analysis of propane monooxygenase A (prmA) from representatives of the genus Rhodococcus whith prmA available at NCBI
dc.typeDiplomas
Файли
Контейнер файлів
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
162_Shurhin_ Maksym_Yuriyovych1.docx
Розмір:
39.9 KB
Формат:
Microsoft Word XML
Завантажити
Ліцензійна угода
Зараз показуємо 1 - 1 з 1
Ескіз недоступний
Назва:
license.txt
Розмір:
1.71 KB
Формат:
Item-specific license agreed upon to submission
Опис:
Завантажити
Зібрання
Бакалаври Біолог. ф-т