Біологічна різноманітність бактерій грунту батіалі та поверхневих вод Чорного моря
Вантажиться...
Дата
2015
Науковий керівник
Укладач
Редактор
Назва журналу
ISSN
E-ISSN
Назва тому
Видавець
Тернопільський національний педагогічний університет імені Володимира Гнатюка
Анотація
Метагеномний аналіз морської води Одеського прибережжя виявив наявність представників
1006 оперативних таксономічних одиниць (OTO) 8 основних філюмів домену Bacteria.
Встановлено співвідношення функціональних кластерів груп генів метагеному, що
відповідають за біологічні процеси, молекулярно-біологічні функції та синтез клітинних
компоненти. ПЛР-аналіз виявив присутність в пробах морського ґрунту унікальні специфічні
послідовності нуклеотидів для представників анаммоксбактерій родів Candidatus Brocadia и
Candidatus Kuenenia, Scalidua wagneri і Scalidua sorokinii. Вперше у зразках глибоководного
ґрунту сірководневої батіалі Чорного моря виявлено аеробні мікроорганізми, притаманні для
поверхневих вод у кількості до 104 КУО. За результатами аналізу жирно-кислотного складу та
ПЛР-аналізу досліджувані штами віднесені до 15 видів спороутворювальних аеробних
бактерій.
Метагеномный анализ морской воды Одесского прибережья выявил наличие представителей 1006 оперативных таксономических единиц (ОТЕ) 8 основных отделов домена Bacteria. Установлено соотношение функциональных кластеров групп генов, что отвечают за биологические процессы, молекулярно-биологические функции и синтез клеточных компонентов. ПЦР-анализ выявил присутствие в пробах морской почвы уникальных специфических последовательностей нуклеотидов для представителей анаммоксбактерий родов Candidatus Brocadia и Candidatus Kuenenia, Scalidua wagneri и Scalidua sorokinii. Впервые в образцах глубоководной почвы сероводородной батиали Черного моря обнаружены аэробные микроорганизмы, характерные для поверхностных вод, в количестве до 104 КОЕ. По результатам анализа жирно-кислотного состава и ПЦР-анализа исследуемые штаммы отнесены к 15 видам аэробных бактерий, образующих эндоспоры.
The metagenome analysis of the seawater along Odesa coast revealed the presence of 1006 operational taxonomic units (OTU) belonging to 8 main phyla of Bacteria Domain. There was established the correlation of functional gene clusters responsible for biological processes, molecularbiological activity and cellular components synthesis. The PCR analysis of marine soil samples revealed the unique specific nucleotide sequences of anammox bacteria genera Candidatus Brocadia and Candidatus Kuenenia, Scalidua wagneri and Scalidua sorokinii. For the first time anaerobe microorganisms typical for surface water were explored in samples of the Black Sea deepwater bathyal zone soil in amount up to 104 CFU. The fatty acid composition and PCR analysis showed that studied strains belong to 15 species of aerobic endospore-forming bacteria.
Метагеномный анализ морской воды Одесского прибережья выявил наличие представителей 1006 оперативных таксономических единиц (ОТЕ) 8 основных отделов домена Bacteria. Установлено соотношение функциональных кластеров групп генов, что отвечают за биологические процессы, молекулярно-биологические функции и синтез клеточных компонентов. ПЦР-анализ выявил присутствие в пробах морской почвы уникальных специфических последовательностей нуклеотидов для представителей анаммоксбактерий родов Candidatus Brocadia и Candidatus Kuenenia, Scalidua wagneri и Scalidua sorokinii. Впервые в образцах глубоководной почвы сероводородной батиали Черного моря обнаружены аэробные микроорганизмы, характерные для поверхностных вод, в количестве до 104 КОЕ. По результатам анализа жирно-кислотного состава и ПЦР-анализа исследуемые штаммы отнесены к 15 видам аэробных бактерий, образующих эндоспоры.
The metagenome analysis of the seawater along Odesa coast revealed the presence of 1006 operational taxonomic units (OTU) belonging to 8 main phyla of Bacteria Domain. There was established the correlation of functional gene clusters responsible for biological processes, molecularbiological activity and cellular components synthesis. The PCR analysis of marine soil samples revealed the unique specific nucleotide sequences of anammox bacteria genera Candidatus Brocadia and Candidatus Kuenenia, Scalidua wagneri and Scalidua sorokinii. For the first time anaerobe microorganisms typical for surface water were explored in samples of the Black Sea deepwater bathyal zone soil in amount up to 104 CFU. The fatty acid composition and PCR analysis showed that studied strains belong to 15 species of aerobic endospore-forming bacteria.
Опис
Ключові слова
Чорне море, батіаль, планктон, мікробіота, біологічна різноманітність, 16S рРНК аналіз, метагеноміки, Черное море, батиаль, планктон, микробиота, биологическое разнообразие, 16SрРНК анализ, метагеномика, Black Sea, bathyal zone, plankton, microbiota, biological diversity, 16S rRNA analysis, metagenomics
Бібліографічний опис
Наукові записки Тернопільського національного педагогічного університету імені Володимира Гнатюка