Biosynthetic clusters of secondary metabolite genes identified in the genome of Bacillus subtilis strain 200
Вантажиться...
Дата
2024
Науковий керівник
Укладач
Редактор
Назва журналу
ISSN
E-ISSN
Назва тому
Видавець
Odesa I. I. Mechnikov National University
Анотація
The Bacillus subtilis 200 strain, isolated from a sample of bottom sediments of the anaerobic zone of the Black Sea, demonstrated antagonistic activity against Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, Salmonella enterica, Klebsiella pneumoniae and Bacillus subtilis, especially high against Proteus vulgaris, Staphylococcus aureus, Bacillus cereus and Candida albicans. After analyzing the genome of Bacillus subtilis 200 on the antiSMASH server, 15 regions were identified in which secondary metabolites are produced. Most of the clusters belong to the NRPS and PKS type. This strain is capable of synthesizing a variety of secondary metabolites such as terpenes, glycocins, metallophores, subtylosin-A, taililanstatin A, bacillisin, and surfactin. Thus, the Bacillus subtilis 200 strain produces many secondary metabolites with a wide spectrum of biological activity, which can be used in the production of new drugs.
Штам Bacillus subtilis 200, ізольований з проби донних відкладень анаеробної зони Чорного моря, продемонстрував антагоністичну активність до Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, Salmonella enterica, Klebsiella pneumoniae і Bacillus subtilis, особливо високу до Proteus vulgaris, Staphylococcus aureus, Bacillus cereus та Candida albicans. Після аналізу геному Bacillus subtilis 200 на сервері antiSMASH було виявлено 15 регіонів, в яких продукуються вторинні метаболіти. Більшість кластерів відноситься до типу NRPS та PKS. Цей штам здатний до синтезу різноманітних вторинних метаболітів, таких як терпени, глікоцини, металофори, субтилозин-А, таїланстатин A, бацилізин та сурфактин. Таким чином, штам Bacillus subtilis 200 продукує багато вторинних метаболітів з широким спектром біологічної активності, які можуть бути використані при виробництві нових лікарських засобів.
Штам Bacillus subtilis 200, ізольований з проби донних відкладень анаеробної зони Чорного моря, продемонстрував антагоністичну активність до Pseudomonas aeruginosa, Escherichia coli, Salmonella enterica, Klebsiella pneumoniae і Bacillus subtilis, особливо високу до Proteus vulgaris, Staphylococcus aureus, Bacillus cereus та Candida albicans. Після аналізу геному Bacillus subtilis 200 на сервері antiSMASH було виявлено 15 регіонів, в яких продукуються вторинні метаболіти. Більшість кластерів відноситься до типу NRPS та PKS. Цей штам здатний до синтезу різноманітних вторинних метаболітів, таких як терпени, глікоцини, металофори, субтилозин-А, таїланстатин A, бацилізин та сурфактин. Таким чином, штам Bacillus subtilis 200 продукує багато вторинних метаболітів з широким спектром біологічної активності, які можуть бути використані при виробництві нових лікарських засобів.
Опис
Ключові слова
biosynthetic gene clusters, secondary metabolites, Bacillus subtilis, кластери біосинтетичних генів, вторинні метаболіти
Бібліографічний опис
Aleksandrovych D. Biosynthetic clusters of secondary metabolite genes identified in the genome of Bacillus subtilis strain 200 / D. Aleksandrovych, N. Vasylieva N. // Modern Problems of Biology, Biotechnology and Biomedicine [Electronic Resource] : XІХ International Summer School “Molecular Biology, Biotechnology and Biomedicine” : Conference for young scientists (Odesa, 3-4 July 2024) : Proceedings / Ed. board : O. V. Sashchuk, Zh. Yu. Sergieieva ; resp. ed. V. O. Ivanytsia. – Odesa : Odesa I. I. Mechnikov National University, 2024. – P. 76–79.
DOI
ORCID:
УДК
575.112:575.113:575.22:631.524