Результат метагеномного аналізу проб морської води Чорного моря
Ескіз недоступний
Дата
2018
Автори
Науковий керівник
Укладач
Редактор
Назва журналу
Номер ISSN
Номер E-ISSN
Назва тому
Видавець
Одеський національний університет імені І. І. Мечникова
Анотація
Проведено метагеномний аналіз прибережної морської води Одеської бухти з метою визначення мікробного біорізноманіття. На основі платформи Illumina MiSeq було здійснено таргетне секвенування v4 ділянки 16S рРНК гена.
В результаті метагеномного 16S рРНК аналізу були виявлені основні відділи домену Bacteria: Proteobacteria, Bacteroidetes, Cyanobacteria, Firmicutes, Actinobacteria, Verrucomicrobiota, Deferribacteres, Planctomycetes, Tenericutes та інші. Показана присутність відділів, які не були визначені раніше – Aquificae, Deinococci, Thermotogae, Ignavibacteriales, Fibrobacteri. Показано присутність невеликої кількості (менше 0,5% від усіх послідовностей) архей. Проведений порівнянний аналіз результатів метагеномного аналізу 16S рРНК проби води Чорного моря з побережжя Одеської бухти і вод Причорноморських лиманів, відкритої зони Чорного моря біля острова Зміїний та даними метагеномного аналізу Світового океану.
Роботу викладено на 69 сторінках, вона містить 3 таблиць та 21 рисунків. Наведено посилання на 62 джерел літератури (8 кирилицею та 54 латиницею).
The fauna and the aspects of ecology of herpetobiont beetles on the South West of Odessa region were studied. The fauna of herpetobiont beetles includes 32 species from 9 families. The peculiarities of habitat distribution and the species richness of herpetobiont beetles of the study area were analyzed. By means of the Margalef index, species diversity is estimated, by means of Soerensen-Chekanovsky index – the similarity of the species composition of individual biotopes. Diploma thesis is expounded on 52 pages, it contains 7 tables and 7 figures. It provides links to 55 references (50 cyrillic and 5 latinic).
The fauna and the aspects of ecology of herpetobiont beetles on the South West of Odessa region were studied. The fauna of herpetobiont beetles includes 32 species from 9 families. The peculiarities of habitat distribution and the species richness of herpetobiont beetles of the study area were analyzed. By means of the Margalef index, species diversity is estimated, by means of Soerensen-Chekanovsky index – the similarity of the species composition of individual biotopes. Diploma thesis is expounded on 52 pages, it contains 7 tables and 7 figures. It provides links to 55 references (50 cyrillic and 5 latinic).
Опис
Ключові слова
091 біологія, Чорне море, прибережна морська вода, метагеномний 16S рРНК аналіз, морська мікробна різноманітність, the Black Sea, coastal seawater, the 16S rRNA gene analysis, metagenomics, marine microbial diversity
Бібліографічний опис
Дубровіна, О. А. Результат метагеномного аналізу проб морської води Чорного моря = The result of metagenome analysis of Black Sea water samples : дипломна робота магістра / О. А. Дубровіна; наук. кер. Н. Ю. Васильєва; ОНУ ім. І.І. Мечникова, Біол. ф-т, Каф. мікробіології і вірусології. – Одеса, 2018. – 69 с.