Вісник Одеського національного університету. Біологія
Постійне посилання зібрання
Галузь та проблематика: “Вісник ОНУ. Біологія” висвітлює експериментальні та теоретичні дані про особливості будови, розвитку та функціонування рослинних і тваринних організмів, флору і фауну України, біохімічні основи регуляції у клітинах і органах, досягнення генетики і біотехнології, проблеми екології та збереження біорізноманіття; історію біологічного факультету та Одеського національного університету імені І. І. Мечникова.
DOI 10.18524/2077-1746
Повні тексти видання доступні на сайті Нб за посиланням:
http://lib.onu.edu.ua/ukrayinska-biologiya/
Переглянути
Нові надходження
Документ Application of new molecular markers for detecting of gliadin loci polimorphism of Triticum durum Desf.(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2024) Popovych, Yuliia A.; Blagodarova, O. M.; Shkolina, K. S.; Chebotar, Sabina V.; Попович, Юлія Андріївна; Благодарова, O. M.; Чеботар, Сабіна ВіталіївнаDurum wheat is an important raw material in the food processing industry and the main ingredient in the production of pasta. It is mainly grown in the Mediterranean basin (Italy, Turkey, Algeria and Spain, providing 50% of the world’s production).Документ Становлення та розвиток кафедри біохімії Одеського національного університету імені І. І. Мечникова(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2024) Петров, Сергій Анатолійович; Чернадчук, Сніжана Сергіївна; Будняк, Олександр Костянтинович; Сорокін, Андрій Вікторович; Petrov, Serhii A.; Chernadchuk, Snizhana S.; Budniak, Oleksandr K.; Sorokin, Andrii V.Розглянуто основні етапи становлення та розвитку кафедри біохімії Одеського національного університету імені І. І. Мечникова: від заснування медичного факультету Імператорського Новоросійського університету (1901) до реорганізації кафедр біологічного факультету Одеського національного університету (2022). Показано внесок видатних вчених, які працювали на кафедрі у різні роки. Охарактеризовано основні здобутки, пріоритети та головні направлення діяльності кафедри.Документ Порівняльна оцінка протизапальної активності кверцетину та диклофенаку натрію на моделі карагінанового запалення у щурів(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2024) Молодан, Юлія Олегівна; Ларіонов, В. Б.; Molodan, Yuliia O.; Larionov, V. B.Нестероїдні протизапальні засоби загалом вважаються основним засобом лікування запальних реакцій, проте їх тривале застосування може викликати побічні ефекти. З урахуванням ролі активних форм оксигену у запаленні, застосування біофлавоноїдів, що виявляють антиоксидантні властивості, може бути ефективним у деяких формах запалення. Тому у роботі досліджували порівняльну протизапальну дію кверцетину та диклофенаку натрію на моделі запалення, яке викликали у щурів шляхом введення у лапу 0,1 мл 1% карагінану. Протизапальну ефективність препаратів визначали за розмірами набряку протягом доби, маркерами запалення у сироватці крові та ділянці пошкодженої кінцівки тварин: активністю еластази, кислої фосфатази та вмісту малонового діальдегіду. Встановлено, що диклофенак виявляє більшу протиексудативну і протизапальну дію, а кверцетин – значнішу антиоксидантну активність в умовах карагінанового запалення. Результати дослідження підтверджують можливу користь застосування біофлавоноїдів, зокрема кверцетину, в лікуванні запальних станів.Документ In silico study of the anti-inflammatory properties of PFOA, PFOS, KClO4, and AlCl3(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2024) Bendas, S. I.; Galkin, Borys M.; Kyrylenko, Natalia A.; Бендас, С. І.; Галкін, Борис Миколайович; Кириленко, Наталя АнатоліївнаIntroduction. Military operations cause great damage to the environment. The great-est environmental threat in this situation is chemical pollution (carbon oxides, nitro-gen oxides, formaldehyde, hydrogen cyanide, potassium perchlorate, aluminum and various toxic organic substances). In addition, ammunition may contain per- and polyfluoroalkyl substances (PFAS), which are characterized by exceptional envi-ronmental stability. Among the most famous PFAS are perfluorooctane sulfonic acid (PFOS) and perfluorooctanoic acid (PFOA), which exhibit exceptional stability and resistance to degradation. In our opinion, these chemical compounds are highly toxic and can enhance inflammatory processes in the body. Aim. to study the potential toxicity of perfluorooctanoic acid, perfluorooctane sulfonic acid, AlCl₃ and KClO4 using in silico approaches. Methods. The toxicity of aluminum chloride, potassium perchlorate, perfluorooctanoic acid, and perfluorooctane sulfonic acid was calculated using the ProTox 3.0 virtual laboratory based on machine learning algorithms. Molecular docking was performed using AutoDock Vina 1.2.5. (http://vina.scripps.edu), Schrödinger Maestro–2023–2 Glide (trial license). The molecular docking procedure was performed using the crystal structure of human serum albumin (7Z57), crystal structures of the ligand-binding domain of human PPAR-gamma (2F4B), human monoamine oxidase A in complex with clorgyline (2BXR), human COX-1 Crystal Structure (6Y3C) from the PDB database of biological macromolecules (http://www.rcsb.org/). During the studies, docking of perfluorooctanoic acid and perfluorooctane sulfonic acid was performed. Molecular dynamics simulations were performed for the complex (perfluorooctanoic acid – human serum albumin, AlCl3 – human serum albumin) using the PlayMolecule software. Results. Based on the ProTox 3.0 virtual laboratory based on machine learning for toxicity prediction, all compounds (KClO4, AlCl3, perfluorooctanoic acid, perfluorooctanoic sulfonic acid) show significant toxicity potential through several pathways such as carcinogenicity, nephrotoxicity for perfluorooctanoic acid, respiratory toxicity for perfluorooctanoic sulfonic acid, cardiotoxicity for AlCl3 and estrogen receptor alpha toxicity for KClO4. According to ProTox 3.0, perfluorooctanoic acid and perfluorooctanoic sulfonic acid can interact with prostaglandin G/H synthase 1 and amine oxidase A. Human serum albumin showed the best docking score and binding free energy among the target proteins when docked with perfluorooctanoic acid and perfluorooctanoic sulfonic acid. The molecular docking results indicate that PFOS has moderate binding affinities with Monoamine Oxidase A and COX-1. These results are theoretical predictions and require further experimental studies. Conclusions. Toxicity studies using the ProTox 3.0 virtual laboratory and molecular docking revealed significant toxicological potential of the compounds tested (KClO₄, AlCl₃, perfluorooctanoic acid, perfluorooctanoic acid). Binding of PFOA to human serum albumin, resulting in its stabilization, may disrupt many of the essential functions that HSA performs in the blood. This binding may promote bioaccumulation, interfere with normal transport processes, affect drug efficacy, and potentially lead to chronic health problems due to ongoing exposure to PFAS toxicity. Thus, the persistence of PFOA-bound HSA in the circulation may be a pathway for long-term exposure and associated health risks.Документ Історія мікологічних досліджень у Одеському (Новоросійському) університеті (1865–1890 рр.)(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2024) Кузнєцов, Вячеслав Олександрович; Ткаченко, Федір Петрович; Kuznietsov, Viacheslav O.; Tkachenko, Fedir P.Проаналізовано початок мікологічних досліджень на півдні України у другій половині ХІХ століття. Встановлено, що спеціальні дослідження грибів і лишайників регіону здійснювали професори Одеського (Новоросійського) університету: Л. С. Ценковський, О. О. Янович, Я. Я. Вальц, Л. А. Рішаві, І. І. Мечников, а пізніше і їх учні – випускники університету – М. К. Срединський, І. Ф. Кощуг, В. Ф. Хмелевський, І. М. Красильщик, В. І. Шманкевич, О. І. Погібко та Є. Л. Рекало. У їх працях представлені перші узагальнення мікобіоти регіону. До них додавалися списки і перші описи деяких видів слизовиків та лишайників. Особлива увага вчених цього періоду була акцентована на розробці методів біологічної боротьби зі шкідниками сільськогосподарських культур (пшениці та цукрового буряку) з використанням грибів-паразитів. Вивчалися хвороби рослин, збудниками яких є паразитичні гриби і розроблялися заходи боротьби з ними. Досліджувалася біологія розвитку окремих видів грибів.Документ Прогнозування механізмів взаємодії кверцетину, α-циперметрину та його похідних з α-рецептором естрогену (дослідження in silico)(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2024) Акішева, Аліна Сергіївна; Сідлецький, Олексій Сергійович; Молодан, Юлія Олегівна; Макаренко, Ольга Анатоліївна; Akisheva, Alina S.; Sidletskyi, Oleksii S.; Molodan, Yuliia O.; Makarenko, Olga A.Проведено докінг-аналіз кверцетину, α-циперметрину та його метаболітів 3-РВА та DCCA з ліганд-зв’язуючими доменами α-рецептору естрогену. Також досліджена лікоподібність кверцетину. Встановлено, що всі досліджувані сполуки мали афінність до рецептору естрогену. За допомогою програмного забезпечення AutoDock та AutoDockVina з’ясована здатність α-циперметрину та його метаболітів проявляти агоністичну дію по відношенню до α-рецептору естрогену, в той час, як за оцінкою Schrödinger Maestro Glide вони є антагоністами даного рецептору. Кверцетин виступає агоністом α-рецептору естрогену. Застосування кверцетину проти ендокринних порушень, викликаних α-циперметрином, є доцільним через лікоподібні характеристики флавоноїду.Документ Дослідження ефективності хлорвмісних комерційних засобів знезараження води проти коліформних бактерій(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2024) Сачковська, Вікторія Ігорівна; Зінченко, Оксана Юріївна; Жуков, Б. С.; Кравець, С. С.; Sachkovska, Viktoriia I.; Zinchenko, Oksana Yu.; Zhukov, B. S.; Kravets, S. S.Вивчали ефективність семи засобів для знезараження води двох українських та п’яти закордонних виробників. Доведено, що усі досліджені засоби відповідають критеріям ВООЗ щодо забезпечення захисту від бактеріальних інфекцій. Вітчизняні препарати мають порівнювану з закордонними аналогами ефективність за низької собівартості знезараженої води та можливості отримувати її у великих об’ємах.Документ Видовий склад і чисельність птахів пониззя Тилігульського лиману навесні 2019–2023 років(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2024) Стойловський, Володимир Петрович; Ківганов, Дмитро Анатолійович; Stoilovskyi, Volodymyr P.; Kivganov, Dmytro A.Протягом 2019–2023 рр. проведено моніторинг видового складу та чисельності гідрофільних птахів в пониззі Тилігульського лиману у період їх весняних концентрацій та міграції. Зареєстровано 99 видів птахів 13 рядів, з яких за чисельністю домінували Anseriformes, Gruiformes, Charadriiformes та Passeriformes. Встановлено певні тенденції щодо зміни чисельності репрезентативних видів птахів.Документ Intraspecific aggressiveness of three species of Gobiidae fish of the genus Ponticola Iljin, 1927 in laboratory conditions(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2024) Karavanskyi, Yurii V.; Zamorov, Veniamin V.; Караванський, Юрій Вікторович; Заморов, Веніамін ВеніаміновичThe intensity of intraspecific aggressiveness of three species of gobiidae fish of the genus Ponticola was studied – Pinchuk’s goby Ponticola cephalargoides (Pinchuk, 1976), mushroom goby Ponticola eurycephalus (Kessler, 1874) and ratan goby Ponticola ratan (Nordmann, 1840). A different level of intraspecific aggressiveness is shown in the investigated fish species. Pinchuk’s goby showed the greatest aggressiveness – its single-sex and mixed groups behaved more aggressively than groups of mushroom goby and ratan goby. At the same time, indicators of the intensity of aggressiveness in the groups of mushroom goby and ratan goby did not show a statistically significant difference between these two fish species.Документ Дослідження генотоксичного впливу гербіциду «Федерал» на модельному об’єкті Danio rerio, Hamilton, 1822. Повідомлення 1. Вплив високих концентрацій(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2024) Кузнецов, М. К.; Січняк, Олександр Львович; Kuznetsov, M. K.; Sichniak, Oleksandr L.Досліджували дію гербіцидного препарату «Федерал» у концентраціях 5, 10 та 15 мг/л на модельному об’єкті Danio rerio в умовах in vivo. Виявлено достовірний вплив досліджуваних концентрацій препарату на збільшення частоти еритроцитів з мікроядрами. Генотоксичний вплив посилювався із збільшенням тривалості обробки до 96 годин. Подальше збільшення тривалості обробки не вплинуло суттєво на збільшення частоти клітин з мікроядрами.Документ Preference of molecular markers for detecting allelic variants of gliadins(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2023) Popovych, Yuliia A.; Blagodarova, O. M.; Chebotar, Sabina V.; Попович, Юлія Андріївна; Чеботар, Сабіна ВіталіївнаThe main method of studying allelic variants of gliadins is electrophoresis in acidic PAGE, which actually shows the phenotype determined by the set of genes of the gliadin-encoding locus. This method is difficult to use, because peptides encoded by all gliadin-encoding loci are present on one lane of the gel and may overlap. Therefore, there is a need for molecular markers that would allow the determination of allelic variants of gliadins using PCR. This will help to use gliadins for marker-asissted selection, to identify allelic variants of gliadins even before obtaining grain suitable for electrophoresis of storage proteins. In this regard, the aim of study was to analyze polymorphism of Gli‑1 loci using allele-specific molecular markers and microsatellites and find suitable molecular markers for detecting allelic variants of gliadins by PCR method.Документ Антиоксидантна ефективність профілактичного комплексу з кверцетином у оваріоектомованих щурів(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2023) Сідлецький, Олексій Сергійович; Макаренко, Ольга Анатоліївна; Sidletskyi, Oleksii S.; Makarenko, Olga A.Проведено дослідження щодо впливу оваріоектомії та неповноцінної за кальцієвим та білковим складом дієти на окремі показники антиоксидантно-прооксидантної системи організму щурів, а також визначення антиоксидантної ефективності профілактичного комплексу на основі кверцетину, вітамінів, макро- і мікроелементів у оваріектомованих самок з аліментарним дефіцитом білка і кальцію. З’ясовано, що за умови патології відбувалось пригнічення антиоксидантної системи захисту на тлі активації перекісного окиснення ліпідів. Застосування комплексу біологічно активних речовин ефективно попереджувало встановлені порушення.Документ Гістоморфометрична оцінка змін структурних компонентів кістки у щурів з хронічним холестазом при корекції комплексом із гепатопротектора та сорбенту(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2023) Рижко, Ірина Леонідівна; Косенко, Тетяна Василівна; Макаренко, Ольга Анатоліївна; Ryzhko, Iryna L.; Kosenko, Tetiana V.; Makarenko, Olga A.Проведено гістоморфометричну оцінку змін структурних компонентів стегнової кістки у щурів із модельованим хронічним холестазом та при корекції комплексом, який складався з гепатопротектора та сорбенту. Показано, що хронічний холестаз призводить до виражених патологічних змін основних компонентів кістки, а застосування комплексу ефективно усуває встановлені порушення, завдяки компонентам гепатопротектора (лецитину і кверцетину) та сорбенту (сорбент та джерело макро- і мікроелементів).Документ Тваринні моделі in vivo для скринінгу потенційних протизапальних та знеболювальних засобів (огляд літератури)(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2023) Молодан, Юлія Олегівна; Ларіонов, В. Б.; Борисюк, І. Ю.; Макаренко, Ольга Анатоліївна; Molodan, Yuliia O.; Larionov, V. B.; Borysiuk, I. Yu.; Makarenko, Olga A.Дослідження на тваринних моделях є ключовим етапом у розробці нових лікарських препаратів. Незважаючи на різноманітність моделей in vivo, правильний вибір моделі є важливим етапом доклінічного дослідження потенційних сполук. Було розглянуто поширені моделі скринінгу потенційних протизапальних та знеболювальних засобів, надано їх переваги та обмеження, що є важливим визначальним чинником при виборі найбільш придатної стратегії для подальших досліджень.Документ Molecular insights into propoxazepam interaction with TRPV1 receptors: a docking analysis(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2023) Larionov, V. B.; Golovenko, M. Ya.; Akisheva, Alina S.; Valivodz, I. P.; Borysiuk, I. Yu.; Molodan, Yuliia O.; Makarenko, Olga A.; Ларіонов, В. Б.; Головенко, М. Я.; Акішева, Аліна Сергіївна; Валіводзь, І. П.; Борисюк, І. Ю.; Молодан, Юлія Олегівна; Макаренко, Ольга АнатоліївнаIn this study, we used molecular docking modelling to investigate the interaction between propoxazepam (new analgesic), and the transient receptor potential vanilloid type 1 receptors. Propoxazepam has the necessary pharmacophoric features of the pharmacophore model of TRPV1 ligands. Propoxazepam creates hydrogen bond between TYR511 of the TRPV1 receptor as well as referent ligand SB-366791.Документ Перша знахідка виду Oecobius rhodiensis Kritscher, 1966 (Aranei: Oecobiidae) в Одеській області(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2023) Делі, Ольга Федорівна; Трач, В'ячеслав Анатолійович; Підгорна, Світлана Яківна; Черничко, Катерина Йосипівна; Deli, Olha F.; Trach, Viacheslav A.; Pidhorna, Svitlana Ya.; Chernychko, Kateryna Y.Вперше в Одеській області та вдруге в Україні відмічений павук Оecobius rhodiensis Kritscher, 1966 з родини Oecobiidae. Павук реєструється на стінах будівель, в під’їздах житлових будинків та на підвіконнях у квартирах. Найбільшу кількість особин павуків було відмічено на стінах будівель. Статевозрілі особини павуків відмічались протягом червня–липня.Документ Iсторія ботанічних досліджень району Тилігульського лиману(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2023) Попова, Олена Миколаївна; Рогозін, С. Ю.; Popova, Olena M.; Rohozin, S. Y.Проведено аналіз 122 літературних джерел, що стосуються рослинного світу району Тилігульського лиману, від античного періоду до наших часів. Встановлено, що перші відомості про рослинний світ території з конкретною вказівкою місця та рослин датуються 1794 р. Загалом на території за літературними даними можна ідентифікувати трохи більше 400 видів рослин. Созофітна фракція виявленої флори складає 57 видів, з них 31 – з Червоної книги України. Підтверджено, що флора та рослинність району Тилігульського лиману комплексно не вивчалися, повного списку флори та созофітів не містить жодне літературне джерело.Документ Ефективність препаратів цитокінінів для покращення калюсогенезу та фізіологічного стану щеп винограду (Vitis vinifera L.)(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2023) Артюх, М. М.; Якуба, Ірина Петрівна; Ружицька, Ольга Миколаївна; Назарчук, Юлія Сергіївна; Степаненко, Н. І.; Artyukh, M. M.; Yakuba, Iryna P.; Ruzhytska, Olha M.; Nazarchuk, Yuliia S.; Stepanenko, N. I.Досліджено дію препаратів з цитокінінами X–Cyte та MC Set на індукцію калюсогенезу та фізіологічні показники щеп винограду. Обробку препаратами здійснювали замочуванням чубуків та щеп перед посадкою у шкілку та обприскуванням рослин винограду у шкілці. Показано стимуляцію колюсогенезу та зростання компонентів щеп, органогенезу та приживлюваності щеп у шкілці. Обробка сприяла підвищенню вмісту хлорофілу, інтенсивності дихання листків, покращенню показників водного режиму листків та ростових показників рослин. Cаджанці містили більше запасних вуглеводів, вихід саджанців збільшився. Більшу ефективність проявив MC Set від Valagro із вмістом цитокінінів 0,06%.Документ Життя та науково-педагогічна діяльність ботаніка, історика науки та педагога, професора Дмитра Олександровича Байкова (1818–1884)(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2023) Кузнєцов, Вячеслав Олександрович; Kuznietsov, Viacheslav O.Проблема. Професор зоології і ботаніки Д. О. Байков працював в декількох навчальних закладах м. Одеси: Одеський (Новоросійський) університет (1865- 1866) Рішельєвський ліцей, (1850-1865), Одеський інститут шляхетних дівчат (1854-1868), гімназія Рішельєвського ліцею (1850-1854), 2-е міське дівоче училище (1854-1868). Його життя та діяльність висвітлені у багатьох біографічних статтях, але в них наводиться велика кількість неточних і суперечливих даних. Жоден з авторів не наводить навіть дат і місця його народження, смерті і поховання. Мета. Метою нашого дослідження стало уточнення основних біографічних даних і результатів науково-педагогічної діяльності професора Д. О. Байкова. Основні результати. На підставі вивчення архівних та офіційних друкованих документів ХІХ – початку ХХ ст. встановлено основні дати життя та науково- педагогічної діяльності професора за кафедрою зоології та порівняльної анатомії Одеського (Новоросійського) університету Дмитра Олександровича Байкова. Показана його роль в розвитку і становленні вищої та жіночої освіти в м. Одесі у другій половині ХІХ ст. Висновки. Вперше документально установлено основні дати життя та науково-педагогічної діяльності професора Д. О. Байкова – 25 (13).10.1818 – 22 (10).09.1884; вперше введено в науковий обіг данні 12 одиниць зберігання трьох державних архівів та 9 друкованих документів, які раніше не були відомі біографам вченого та спеціалістам у галузі біографістики; надані аргументи для переосмислення деяких висновків щодо діяльності професора Д. О. Байкова у закладах освіти різних типів.Документ Корекція порушень у травному тракті щурів з хронічним холестазом комплексом Леквін і Мінерол(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2023) Макаренко, Ольга Анатоліївна; Могилевська, Тетяна Василівна; Makarenko, Olga A.; Mohylevska, Tetiana V.В дослідженні на щурах з хронічним холестазом показано, що зниження антитоксичної функції печінки призвело до розвитку запалення у слизо-вих оболонках порожнини рота, тонкої та товстої кишок, що може виклика-ти погіршення засвоєння поживних речовин. Застосування профілактичного комплексу ефективно усувало встановлені порушення, завдяки компонентам Леквіну (лецитину і кверцетину) та Мінеролу (сорбент та джерело макро- та мікроелементів).