Алелі гена Ppd-D1 у зразках колекції Aegilops tauschii і м’якої пшениці
Дата
2012
Науковий керівник
Укладач
Редактор
Назва журналу
Номер ISSN
Номер E-ISSN
Назва тому
Видавець
Анотація
Світловий період суттєво впливає на ріст і розвиток рослин. Одним із головних генів чутливості до фотоперіоду
є Ppd-Dl з родина PRR, розташований на хромосомі 2D. Мета роботи поляга ла у визначенні
алельного стану і молекулярної структури гена Ppd-D 1 у зразках з колекції Ае. tauschii з різними строками
цвітіння та у 29 українських сортів м ’я ко ї пшениці. Методи. Алель-специфічна ПЛР з праймерами
до гена Ppd-Dl, секвенування і Blast-аналіз. Результати. Досліджено колекцію зразків Ае. tauschii та
низку сортів озимої і яр о ї м ’я ко ї пшениці, визначено молекулярну структуру алельних варіантів (414,
429 і 453 п. н.) гена Ppd-Dl b y колекції Ае. tauschii. Висновки. У досліджуваних сортів озимої м ’якої пшениці
присутній алель Ppd-Dla, а серед ярих сортів 60 % відрізняються наявністю алеля P pd-Dlb (розмір
продуктів ампліфікації 414 п. н.). Blast-аналізом нуклеотидних послідовностей цього гена з банків даних
у порівнянні з референсною послідовністю зразка к-1322 з колекції Ае. tauschii показано високий рівень
гомології (від 80 до 100%) між послідовностями генів PRR, характерних для геномів А і D представників
родів Triticum і Aegilops.
Light period significantly influences on the growth and development of plants. One o f the major genes of photo period sen sitivity is P p d -D l, located on the chromosome 2D. The a im o f the work was to determine the alleles a n d molecular structure o f P p d -D l gene in sam ple s from the collection o f Ae. tauschii accessions, which have different flow e r in g periods, a n d in 29 Ukrainian wheat varieties. M e th o d s We used methods o f a llele-specific PC,R with p rime rs to the P p d -D l gene, sequencing an d B last-analysis. Results. The collection o f Ae. tauschii accessions and several varietie s o f winter a n d spring w heat was studied. The molecular structure o f the allelic variants (414. 429 a n d 453 b. p.) o f P p d -D lb gene was determined in the collection o f Aegilops. tauschii accessions. Conc lusions. The P p d -D l a allele was p re sen t in a ll stu d ied varietie s o f winter wheat. 60 % o f spring wheat is characterized by P p d -D lb allele (size o f amplification products 414 b. p.). Blast-analysis o f the sequence data banks on the basis o f the reference sequence o f sample k-1322 fr om the collection o f Ae. tauschii a ccessions has shown a high homology (80 to 100 %>) between the nucleotide sequences o f PRR genes, that characterize the Aand Dg enomes o f representatives o f the genera Triticum and Aegilops.
Световой период существенно влияет на рост и развитие растений. Одним из главных генов чувствительности к фотопериоду является Ppd-Dl, расположенный на хромосоме 2D. Цель работы состояла в определении аллельного состояния и молекулярной структуры гена Ppd-Dl в образцах из коллекции Ае. tauschii с разными сроками цветения и в 29 украинских сортах мягкой пшеницы. Методы Аллель-специфичная ПЦР с праймерами к гену Ppd-Dl, секвенирование и Blast-анализ. Результаты. Исследована коллекция образцов Ае. tauschii и ряд сортов озимой и яровой мягкой пшеницы, определена молекулярная структура аллельных вариантов (414. 429 и 453 п. н.) гена P p d -D lb в коллекции Ае. tauschii. Выводы У исследованых сортов озимой мягкой пшеницы присутствует аллель Ppd-Dla, а среди яровых со рт о в у 60 % определен аллель Ppd-Dlb (размер продуктов амплификации 414 п. п.). Blast-анализом нуклеотидных последовательностей этого гена из банков данных в сравнении с референсной последовательностью образца к-1322 из коллекции Ае. tauschii показан высокий уровень гомологии (от 80 до 100 %) между последовательностями генов PRR, характерных для А- и D-геномов представителей родов Triticum и Aegilops.
Light period significantly influences on the growth and development of plants. One o f the major genes of photo period sen sitivity is P p d -D l, located on the chromosome 2D. The a im o f the work was to determine the alleles a n d molecular structure o f P p d -D l gene in sam ple s from the collection o f Ae. tauschii accessions, which have different flow e r in g periods, a n d in 29 Ukrainian wheat varieties. M e th o d s We used methods o f a llele-specific PC,R with p rime rs to the P p d -D l gene, sequencing an d B last-analysis. Results. The collection o f Ae. tauschii accessions and several varietie s o f winter a n d spring w heat was studied. The molecular structure o f the allelic variants (414. 429 a n d 453 b. p.) o f P p d -D lb gene was determined in the collection o f Aegilops. tauschii accessions. Conc lusions. The P p d -D l a allele was p re sen t in a ll stu d ied varietie s o f winter wheat. 60 % o f spring wheat is characterized by P p d -D lb allele (size o f amplification products 414 b. p.). Blast-analysis o f the sequence data banks on the basis o f the reference sequence o f sample k-1322 fr om the collection o f Ae. tauschii a ccessions has shown a high homology (80 to 100 %>) between the nucleotide sequences o f PRR genes, that characterize the Aand Dg enomes o f representatives o f the genera Triticum and Aegilops.
Световой период существенно влияет на рост и развитие растений. Одним из главных генов чувствительности к фотопериоду является Ppd-Dl, расположенный на хромосоме 2D. Цель работы состояла в определении аллельного состояния и молекулярной структуры гена Ppd-Dl в образцах из коллекции Ае. tauschii с разными сроками цветения и в 29 украинских сортах мягкой пшеницы. Методы Аллель-специфичная ПЦР с праймерами к гену Ppd-Dl, секвенирование и Blast-анализ. Результаты. Исследована коллекция образцов Ае. tauschii и ряд сортов озимой и яровой мягкой пшеницы, определена молекулярная структура аллельных вариантов (414. 429 и 453 п. н.) гена P p d -D lb в коллекции Ае. tauschii. Выводы У исследованых сортов озимой мягкой пшеницы присутствует аллель Ppd-Dla, а среди яровых со рт о в у 60 % определен аллель Ppd-Dlb (размер продуктов амплификации 414 п. п.). Blast-анализом нуклеотидных последовательностей этого гена из банков данных в сравнении с референсной последовательностью образца к-1322 из коллекции Ае. tauschii показан высокий уровень гомологии (от 80 до 100 %) между последовательностями генов PRR, характерных для А- и D-геномов представителей родов Triticum и Aegilops.
Опис
Ключові слова
Aegilops tauschii, м'яка пшениця, алель-специфічна ПЛР, Ppd-Dl, bread wheat, allele-specific PCR, мягкая пшеница, алель-специфичная ПЦР
Бібліографічний опис
Biopolymers and Cell