Перегляд за Автор "Halkin, Mykola B."
Зараз показуємо 1 - 12 з 12
Результатів на сторінці
Налаштування сортування
Документ Amixin effect on different strains of Pseudomonas aeruginosa which have different abilities for biofilm formation(Odessa I. I. Mechnikova National University, 2017) Kladnitskii, V. Y.; Halkin, Mykola B.The study of how tilorone in different concentrations interact with collection strains of Pseudomonas aeruginosa, which have different ability to form the biofilm was performed. For the experiment were prepared five dilutions of tilorone 25, 50, 100, 250 and 500 mcg/ml. To determine the effect of tilorone on the biofilm formation used method for cultivation of the biofilms in the plates for cell culture, using the medium LB. The presence of the biological activity of the compounds judged by the presence of optical density difference between the experimental and control samples. The results showed that the different concentrations of test compound act differently on growth and biofilm formation of test strains Pseudomonas aeruginosa, causing stimulation or inhibition, or nothing changes at all.Документ Biofilm formation and genetic diversity of Lactobacillus plantarum strains originated from France and Ukraine(2019) Limanska, Natalia V.; Merlich, Andrii H.; Halkin, Mykola B.; Vasylieva, Nataliia Yu.; Choiset, Yvan; Ivanytsia, Tetiana; Zlatohurska, Maryna; Ivanytsia, Volodymyr O.; Chobert, Jean-Marc; Мерліч, Андрій Геннадійович; Іваниця, Володимир ОлексійовичEvaluation of Lactobacillus plantarum strains perspective for plant protection or fermentation of food of plant origin should include tests on abilities to attach to plant surfaces and to form biofilms. Comparing RAPD-profiles with these properties and also with geographical origin of the strains is necessary to find out the possibility of rapid selection of the strains and tracking their dissemination. Biofilm formation and RAPD-PCR profiles of 30 strains of L. plantarum isolated from grape must and pickles originated from France and Ukraine were compared. All isolates were able to attach to Lepidium sativum seedlings and form biofilms of different types. Amount of attached cells varied from (7.8 ± 0.2) x 104 to (2.1 ± 0.3) x 103 CFU/cm2. The most developed biofilms were formed on shoots, leaves, seed coat shells. On roots this ability was strain dependent: the majority of French isolates (77.0%) formed separated microcolonies without developed matrix layer. Among Ukrainian isolates, 47.1% of the strains showed the same tendency, and in 41.2% of the strains individual attached cells without formation of microcolonies were observed. The level of initial attachment of bacterial cells to roots did not coincide with the level of subsequent formation of biofilms. Gene plnA was detected in 28.1% of isolates. All plnA possessing strains except the one formed microcolonies or biofilms with developed matrix. Lactobacilli could eliminate the biofilms of Agrobacterium tumefaciens pJZ from tomato roots in 75.0 – 100% of tested samples depending on a strain and method of inoculation. No clear association between the geographical origin of the L. plantarum strains and clustering by RAPD-PCR analysis was found. Two strains with high level of biofilm formation were grouped in one subcluster.Документ Effect of Lactobacillus plantarum on growth characteristics of wheat in hydroponics and soil(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2018) Limanska, Nataliya V.; Sokolova, N. V.; Sudak, A. A.; Halkin, Mykola B.; Ivanytsia, Volodymyr O.; Ліманська, Наталія Вікторівна; Соколова, Н. В.; Судак, А. А.; Галкін, Микола Борисович; Іваниця, Володимир Олексійович; Лиманская, Наталья Викторовна; Галкин, Николай Борисович; Иваница, Владимир АлексеевичThe aim was to study the effect of Lactobacillus plantarum on germination and some growth characteristics of wheat Triticum aestivum L. in hydroponics and soil under greenhouse and field conditions. Materials and Methods. Strains of L. plantarum, their mixtures in a ratio 1:1 had been prepared immediately before the experiment, as well as mixed cultures of these strains which had been cultivated together for at least one week and re-inoculated every two days were used. Before grounding, seeds were inoculated with lactobacilli (in concentrations 1%, 0.1%, 0.01%, 0.001%, 0.0001%, 0.00001%) for an hour. Seed germination, length of the roots and height of the seedlings were calculated as means with standard errors or confidential intervals. Results. Treatment of wheat seeds with individual L. plantarum ONU 12, L. plantarum ONU 311, L. plantarum ONU 355 strains, their mixed cultures grown together and mixtures has increased seed germination in 6.0–40.0% depending on the conditions of germination and inoculum concentration. Under conditions of hydroponics and soil in the greenhouse the best results were shown by inoculums in concentration 103–106 CFU/ml, and under field conditions – in concentration 102–104 CFU/ml. Mixtures and mixed cultures of L. plantarum ONU 12 + L. plantarum ONU 311 and L. plantarum ONU 12 + L. plantarum ONU 355 formed developed biofilms on roots of wheat seedlings. Mean height of seedlings increased in 8.0–41.0%, and the length of the roots increased by 2.4 times in hydroponics and in 6.8 –64.5% in soil. Conclusion. The mixtures and mixed cultures of bacteria L. plantarum ONU 12 + L. plantarum ONU 311 and L. plantarum ONU 12 + L. plantarum ONU 355 could stimulate wheat germination and growth and can be used for development of plant growth promoting bacterial preparations.Документ Fatty acid profiles in planktonic and bi ofi lm P. aeruginosa cells with different level of c-di-GMP(2018) Halkin, Mykola B.; Semenets, Anastasiia S.; Finogenova, M. O.Pseudomonas aeruginosa is a Gram-negative pathogen responsible for a variety of opportunistic infections, including chronic airway infections in patients with cystic fibrosis (CF). During the course of chronic infection, P. aeruginosa forms matrix-encased, surface-associated communities called biofilms. Biofilms are thought to contribute to persistence in the CF airway by contributing to evasion of the host immune response and antimicrobial therapy. Biofilm communities differ from planktonic bacterial cultures not only in terms of their metabolic activity but they also display stage-specific phenotypes during development and considerable spatial heterogeneity of physiological condition. Cells alter the fatty acid composition of their lipids to maintain membrane fluidity with varying environmental conditions. In this study, fatty acid profiles of biofilms versus planktonic cells of the P. aeruginosa with different level of intracellular c-di-GMP were compared.Документ Lactobacilli from plant surfaces: the perspectives for biotechnology(2015) Limanska, Natalia V.; Merlich, Andrii H.; Halkin, Mykola B.; Vasylieva, Nataliia Yu.; Filimonov, Vadym M.; Ivanytsia, Volodymyr O.; Sokol, D.; Sviridov, I. S.; Иваница, Владимир Алексеевич; Іваниця, Володимир Олексійович; Мерліч, Андрій Геннадійович; Мерлич, Андрей ГеннадиевичThe advantages of organic agriculture seem more and more attractive today. That’s why the lactobacilli with their GRAS (Generally Recognized As Safe) status could be the widely used microorganisms in biotechnology of plant protection and stimulation of plant growth.Документ Tilorone effect on Salmonella enteritidis biofilm formation(Odessa I. I. Mechnikova National University, 2017) Kladnitskii, V. Y.; Halkin, Mykola B.The study of how tilorone in different concentrations effect on biofilm formation ability of collection strains of Salmonella enteritidis, was performed. For the experiment were prepared five dilutions of tilorone 25, 50, 100, 250 and 500 mcg/ml. To determine the effect of tilorone on the biofilm formation used method for cultivation of the biofilms in the plates for cell culture, using the medium LB. The presence of the biological activity of the compounds judged by the presence of optical density difference between the experimental and control samples. The results showed that the different concentrations of test compound act differently on growth and biofilm formation of test strains S. enteritidis, causing stimulation or inhibition, or nothing changes at all.Документ Universal description of the biofilms growth dynamic in logistic model(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2018) Huiyu, Zhou; Drahan, Hryhorii S.; Kutarov, Volodymyr V.; Halkin, Mykola B.; Filipova, Tetiana O.; Хуюі, Джоу; Драган, Григорій Сильвестрович; Кутаров, Володимир Володимирович; Галкін, Микола Борисович; Філіпова, Тетяна Олегівна; Хуюи, Джоу; Драган, Григорий Сильвестрович; Кутаров, Владимир Владимирович; Галкин, Николай Борисович; Филиппова, Татьяна ОлеговнаWe study experimental and theoretical dependences of growth dynamics of Pseudomonas aeruginsa biofilms and dynamics of yeast biomass growth. It is revealed that the process of growth of yeast biomass passes into the state of tmax three times faster than the formation of biofilm. Analysis of experimental data showed that the biofilm had been continuously growing in the first three days. After the third day, the accumulation of biomass in the biofilm stopped and for the next four days of biofilm observation it remained constant, which indicates competitive mechanisms of interaction. As can be seen, the population is stable at the second stage. Basic growth regimes of proximity with different dynamic characteristics are shown. The universal description of the biofilms growth dynamic was obtained. Defined parameter of the biological population growth generalized dynamics t* uniquely characterized by N* determining parameter and control parameters α and β. The parameter α is determined by the ratio between the radius of individual activity of the population and the characteristic size of the area. The parameter β is determined by competitive interactions, properties of the environment and by cell-to-cell communication. The universal model was proved for Pseudomonas aeruginsa biofilm. The results of the experiments are consistent with the calculated data.Документ Деструкция фенола при формировании поливидовой биопленки на природных и синтетических носителях в биофильтре(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2019) Гудзенко, Татьяна Васильевна; Конуп, Игорь Петрович; Волювач, Ольга Вячеславовна; Чабан, Николай Николаевич; Горшкова, Елена Георгиевна; Беляева, Тамара Алексеевна; Галкин, Николай Борисович; Гудзенко, Тетяна Василівна; Конуп, Ігор Петрович; Волювач, Ольга В'ячеславівна; Чабан, Микола Миколайович; Горшкова, Олена Георгіївна; Беляєва, Тамара Олексіївна; Галкін, Микола Борисович; Gudzenko, Tetiana V.; Konup, Ihor P.; Voliuvach, Olha V.; Chaban, Mykola M.; Horshkova, Olena H.; Beliaeva, Tamara O.; Halkin, Mykola B.Цель. Определить эффективность процесса очистки воды от фенола микроорганизмами-деструкторами при формировании поливидовой биопленки на природных и синтетических носителях в биофильтре. Методы. В работе использовали ассоциацию бактерий-деструкторов фенола – Aeromonas ichthiosmia ONU552, Васillus subtilis ONU551, Pseudomonas maltophilia ONU329, Pseudomonas fluorescens ONU328, Pseudomonas cepacia ONU327. Окрашивание сформировавшихся биопленок осуществляли 1% раствором акридинового оранжевого. Микроскопию образцов проводили под флуоресцентным микроскопом Primo Star PC и световым микроскопом Carl Ceiss при увеличении ½900, фотографировали с использованием камеры Olympus DCM (3,0 M pixels). Концентрацию фенола в воде определяли экстракционно-фотометрическим методом с использованием 4-аминоантипирина. Результаты. Методом флуоресцентной микроскопии подтверждено, что используемые для очистки воды бактерии-деструкторы фенола образовывали биопленку в биофильтре на носителях разной природы – керамических трубках, створках мидий, торфе, цеолите, активированном угле, синтетическом носителе типа ВИЯ, песке. В лабораторных условиях подтверждена эффективность работы колоночного биофильтра периодического действия проточно-восходящего типа с послойной комплексной загрузкой сорбентов при очистке фенол-содержащей воды (исходная концентрация фенола – 300 мг/л). Через 2 часа работы биофильтра степень очистки воды составляла 40% (остаточная концентрация фенола в воде 180±17,2 мг/л), что было связано с сорбцией фенола на носителях, в процессе биодеструкции она достигала 90% (остаточная концентрация фенола в воде – 29,5±2,8 мг/л) на 6-ой день. В последующие дни эффективность работы био- фильтра при непрерывном поступлении загрязненной фенолом воды была на уровне 50-75%, и в стационарно-циклическом режиме достигала 80- 90% (концентрация фенола в воде варьировала от 29,5±2,8 до 60±5,7 мг/л). Вывод. Новый микробный консорциум образует на природных и синтетических носителях фильтра биопленку, что способствует эффективной очистке воды от фенола и продолжительности работы биофильтра проточного типа (до 2 мес) без дополнительной регенерации.Документ Розробка препаратів на основі молочнокислих бактерій для захисту рослин від фітопатогенів(2018) Ліманська, Наталія Вікторівна; Мерліч, Андрій Геннадійович; Галкін, Николай Борисович; Жунько, Інна Давидівна; Теслюк, Наталія Іванівна; Аврамович, Іванна; Іваниця, Володимир Олексійович; Лиманская, Наталья Викторовна; Мерлич, Андрей Геннадиевич; Галкін, Микола Борисович; Жунько, Инна Давидовна; Теслюк, Наталья Ивановна; Аврамович, Иванна; Иваница, Владимир Алексеевич; Limanska, Natalia V.; Merlich, Andrii H.; Halkin, Mykola B.; Zhunko, Inna D.; Tesliuk, Nataliia I.; Avramovych, Ivanna; Ivanytsia, Volodymyr O.Дослідження впливу молочнокислих бактерій Lactobacillus plantarum і Enterococcus italicus на фітопатогенні та умовно-патогенні мікроорганізми Agrobacterium tumefaciens, Erwinia carotovora, Pseudomonas syringae pv. syringae, Mucor sp., Penicillium sp. показало, що досліджені штами-антагоністи були здатними пригнічувати фітопатогени як на поживних середовищах, так і на тест-рослинах, зменшуючи рівень прояву захворювання на 24,8 – 77,0 %. Досліджені штами молочнокислих бактерій були рекомендовані для розробки біопрепаратів для захисту рослин.Документ Синтез металокомплексів водорозчинних дихінолінілпорфіринів – потенційних антимікробних агентів(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2017) Ішков, Юрій Васильович; Водзінський, С. В.; Галкін, Микола Борисович; Кладько, Л. Г.; Мазепа, О. В.; Ишков, Юрий Васильевич; Водзинский, С. В.; Галкин, Николай Борисович; Кладько, Л. Г.; Мазепа, А. В.; Ishkov, Yurii V.; Vodzinskyi, S V.; Halkin, Mykola B.; Kladko, L. H.; Mazepa, O. V.Конденсацією піролу з сумішшю н-масляного альдегіду та хінолін-3-карбальдегіду в пропіоновій кислоті отримана суміш порфіринів з н-пропільними та 3-хінолінільними замісниками з якої виділені 5,15-ди(н-пропіл),10,20-ди(3-хінолініл)порфірин та 5,15-ди(н-пропіл),10,20-ди(3-хінолініл)порфірин. Взаємодією з солями заліза та марганцю в диметилформаміді отримані відповідні металокомплекси, які переведені в водорозчинну форму кватернізацією метиловим естером п-толуенсульфокислоти в нітрометані.Документ Формування біоплівки штамами Salmonella enteritidis за присутності синтетичних аналогів 2-гептил-3-гідрокси-4-хінолону(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2019) Галкін, Микола Борисович; Водзінський, Сергій Валентинович; Джура, Мар`яна Сергіївна; Стрезєва, Лідія Миколаївна; Галкін, Борис Миколайович; Філіпова, Тетяна Олегівна; Галкин, Николай Борисович; Водзинский, Сергей Валентинович; Джура, Марьяна Сергеевна; Стрезева, Лидия Николаевна; Галкин, Борис Николаевич; Филиппова, Татьяна Олеговна; Halkin, Mykola B.; Vodzinskyi, Sergii V.; Dzhura, Mar`iana S.; Strezieva, Lidiia M.; Halkin, Borys M.; Filipova, Tetiana O.Мета роботы – дослідити формування біоплівки клітинами S. enteritidis за впливу оригінальних похідних 2-гептил-3-гідрокси-4-хінолону (PQS) з різною довжиною алкільного ланцюга. Методи. Клітини тест штамів інкубували у 96-лункових планшетах за присутності 20, 40 та 80 мкМ досліджуваних сполук. Сполуки були поділені на дві групи – зі скороченою та подовженою відносно PQS довжиною алкільного ланцюга. Вміст планктонних клітин визначали спектрофотометрично при довжині хвилі 600 нм. Формування біоплівки оцінювали за допомогою CV-тесту (crystal violet-тесту) спектрофотометрично при довжині хвилі 592 нм. Результати. Отримані результати показали що аналоги PQS зі скороченою довжиною алкільного ланцюга, у більшості випадків знижують вміст планктонних клітин, тоді як похідні з подовженим алкільним ланцюгом виявили тенденцію до стимулювання планктонної культури. PQS і його синтетичні аналоги зі скороченою довжиною алкільного ланцюга або не впливали, або помірно стимулювали формування біоплівки тест-штамами S. enteritidis. На противагу цьому похідні з подовженим алкільним ланцюгом достовірно знижували масу біоплівки на 50–70% у порівняні з контролем. Висновок. Показано, що аналоги сигнального хінолону Pseudomonas aeruginosa з подовженим алкільним ланцюгом є ефективними пригнічувачами утворення біоплівок різними штамами S. enteritidis.Документ Імунологічні методи(Одеський національний університет імені І. І. Мечникова, 2018) Філіпова, Тетяна Олегівна; Гудзенко, Тетяна Василівна; Галкін, Микола Борисович; Зінченко, Оксана Юріївна; Ямборко, Ганна Валентинівна; Русакова, Марія Юріївна; Ямборко, Анна Валентиновна; Филиппова, Татьяна Олеговна; Гудзенко, Татьяна Васильевна; Галкин, Николай Борисович; Зинченко, Оксана Юрьевна; Русакова, Мария Юрьевна; Halkin, Mykola B.; Filipova, Tetiana O.; Gudzenko, Tetiana V.; Zinchenko, Oksana Yu.; Yamborko, Hanna V.; Rusakova, Mariia Yu.Методичні вказівки щодо основних методів, що застосовуються в імунології. Вони містять детальні плани організації лабораторних занять студентів для ознайомлення з основними методами імунології. Рекомендовано для студентів біологічного факультету, що отримують освітній рівень «бакалавр» за спеціальностями «біологія» та «біотехнологія».